沒(méi)有一個(gè)人是通過(guò)探險(xiǎn)而聞名的,但是當(dāng)哥倫布起航去印度的時(shí)候,,他卻發(fā)現(xiàn)了新大陸,;類似地,來(lái)自歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EMBL)的科學(xué)家打算著手去尋找一些可以結(jié)合在RNA上的酶,,結(jié)果他們發(fā)現(xiàn)的東西遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于他們所期望的,,研究者們發(fā)現(xiàn)了300種蛋白質(zhì)都可以結(jié)合到RNA上,而且其中超過(guò)150種蛋白質(zhì)都是已知的,,但是并沒(méi)有人知道這些已知的蛋白質(zhì)可以結(jié)合RNA,。相關(guān)研究成果刊登在了6月1日的國(guó)際雜志Cell上。這項(xiàng)研究將可以幫助我們理解基因和類似糖尿病或青光眼疾病之間的關(guān)系,。
研究者M(jìn)atthias Hentze表示,,我們并不像哥倫布,我們找到了我們想要找到的東西,,更讓人意想不到的是,,我們發(fā)現(xiàn)了一些已知的酶也可以結(jié)合RNA。我們絕對(duì)沒(méi)有想到還有如此多的領(lǐng)域沒(méi)有被開(kāi)發(fā),,尤其是RNA結(jié)合蛋白的發(fā)現(xiàn),。
研究者Hentze和Krijgsveld從事了50年關(guān)于肥胖和青光眼乃至前列腺和胰腺癌的相關(guān)基因功能的研究,這次他們的研究發(fā)現(xiàn)為研究者們研究這些類似的疾病打開(kāi)了一扇窗,,這些疾病發(fā)生有可能并不是病人機(jī)體的功能異常,,而有可能是RNA控制的問(wèn)題。
Hentze實(shí)驗(yàn)室前期研究證明,,酶可以作為遺傳調(diào)節(jié)子結(jié)合到RNA上并控制其功能,。為了更深入的研究,研究者們發(fā)明了一種新的識(shí)別并且分離活細(xì)胞中和RNA結(jié)合的蛋白的方法,,這種新方法將會(huì)有很大用途,,可以被應(yīng)用于其它類型的細(xì)胞中,,并且可以勘察在不同情況下結(jié)合RNA的蛋白質(zhì),這將使得科學(xué)家更深入地學(xué)習(xí)細(xì)胞是如何適應(yīng)壓力環(huán)境,、對(duì)藥物或者機(jī)體代謝的改變做出反應(yīng)的,,而且?guī)椭斫饧膊〉陌l(fā)病機(jī)理。(生物谷Bioon.com)
編譯自:http://www.sciencedaily.com/releases/2012/06/120601103810.htm
doi:10.1016/j.cell.2012.04.031
PMC:
PMID:
Insights into RNA Biology from an Atlas of Mammalian mRNA-Binding Proteins
Alfredo Castello, Bernd Fischer, Katrin Eichelbaum, Rastislav Horos, Benedikt M. Beckmann, Claudia Strein, Norman E. Davey, David T. Humphreys, Thomas Preiss, Lars M. Steinmetz, Jeroen Krijgsveld, Matthias W. Hentze
RNA-binding proteins (RBPs) determine RNA fate from synthesis to decay. Employing two complementary protocols for covalent UV crosslinking of RBPs to RNA, we describe a systematic, unbiased, and comprehensive approach, termed “interactome capture,” to define the mRNA interactome of proliferating human HeLa cells. We identify 860 proteins that qualify as RBPs by biochemical and statistical criteria, adding more than 300 RBPs to those previously known and shedding light on RBPs in disease, RNA-binding enzymes of intermediary metabolism, RNA-binding kinases, and RNA-binding architectures. Unexpectedly, we find that many proteins of the HeLa mRNA interactome are highly intrinsically disordered and enriched in short repetitive amino acid motifs. Interactome capture is broadly applicable to study mRNA interactome composition and dynamics in varied biological settings.