目前在上海市生物制藥產業(yè)中，生物技術的應用領域主要包括生物藥品（如基因藥品,、疫苗）的研發(fā),，生物制劑,、生物信息儀器的研發(fā)以及平臺型的生物模型和篩藥技術的研發(fā)三個方面。
發(fā)展模式及技術來源
上海市生物制藥產業(yè)的成長,，由于技術來源的不同而形成三種主要模式,。
第一種模式為政府主導型。這種模式是由政府作為主要力量整合或重組技術,、資金和人才等資源，協(xié)助組建生物制藥公司,，從而對一些有前景的項目進行研發(fā)并實現(xiàn)產業(yè)化,。起源技術一般是高校或政府下屬的研究院所的技術成果,。這些成果以技術轉讓或技術入股的方式為企業(yè)所擁有,，而政府也可以根據需要直接將一些生物技術的研究中心與現(xiàn)代企業(yè)管理制度相結合，形成企業(yè)與研究所兩套機構并存的特殊組織結構,。
第二種模式是自主成長型,。這種模式是指產業(yè)中的企業(yè)從風險企業(yè)起步，依靠自有核心技術,，經歷封閉公司,、公眾公司等階段發(fā)展起來。在上海市生物制藥產業(yè)中,，“海歸”派和科研院所專家的創(chuàng)業(yè)是自主成長型模式的典型,。這種模式的技術來源一般是創(chuàng)業(yè)者通過多年研究獲得的技術成果，大多擁有自主知識產權,。
第三種模式是轉化型,。這種模式是指一些傳統(tǒng)制藥公司或非制藥行業(yè)公司，為了尋找新的成長空間,，通過投資或技術引進方式進入生物制藥行業(yè),。其對應的技術來源有多樣化特征，可以通過技術模仿,、技術引進,、并購生物技術公司等多種渠道獲得技術。
技術發(fā)展優(yōu)勢與劣勢分析
上海市生物制藥產業(yè)的技術發(fā)展優(yōu)勢主要有以下幾個方面：
第一,，上海的生物制藥產業(yè)擁有很高水平的研發(fā)團隊,，匯集了來自國內外的生物技術領域的優(yōu)秀專家學者。
第二,，上海市生物制藥產業(yè)各類企業(yè)的所在地十分集中,，政府也有意將研究院所和高校實驗室進行匯集（如張江高科技園區(qū)關于生物技術的“一所六中心”），使技術發(fā)展所需的資源比較集中,，研發(fā)及輔助服務的鏈條比較完備,，形成了產業(yè)群聚效應，有利于產業(yè)整體的技術進步。
第三,，上海市上游生物技術的水平更接近國際領先水平,，使得生物制藥產業(yè)的技術發(fā)展有了雄厚的基礎。
第四,，相對國外而言,，我國的生物制藥產業(yè)的基因資源非常。而基因專利保證了基因擁有者對基因應用領域的高度壟斷,，因此上海市生物制藥產業(yè)將由于對基因資源的占有而獲得更廣闊的發(fā)展空間,。
第五，由于美國食品藥品管理局FDA對生物制藥產品的檢測通過標準十分嚴格,，使得當?shù)睾芏嗌锛夹g無法產業(yè)化,，只停留在基礎研究階段，這有利于上海的生物制藥產業(yè)通過技術引進等方式獲取其先進技術,，率先產業(yè)化并占有美國以外的市場,。
但生物制藥產業(yè)對于上海乃至全國來說都是一個新興產業(yè)，其目前在發(fā)展中也存在一些問題和挑戰(zhàn),，具體表現(xiàn)在三個方面,。首先，上海市生物制藥產業(yè)多數(shù)技術成果的活力方式是通過技術轉讓,，而不是通過產業(yè)化推向最終的產品市場,。其次，產業(yè)中的研究機構由于受政府科研計劃的影響,，其經費來源有一定的階段性,，與企業(yè)經營的持續(xù)性形成矛盾從而影響技術研發(fā)的進度。還有,，在生物制藥領域內技術專利的占有量還比較低,。據調研報告顯示，我國生物制藥領域中有90%的專利是國外企業(yè)申請的,，這多少也可以代表上海目前的情況,。
技術跨越模式
對于上海市生物制藥產業(yè)來說，實施跨越就成為首要之工作,，而其技術跨越模式的確定可依據以下幾點：
首先,，生物制藥技術目前進口限制較小，有機會通過技術引進縮短研發(fā)時間,，縮小與國際水平的差距,。其次，生物制藥技術從實驗室到生產之間沒有太多的技術關口,，接口比較容易做,，可以選擇國外已有基礎研究但沒有應用研究的領域率先實現(xiàn)產業(yè)化,，從而獲得自主知識產權。第三,，上海市生物制藥產業(yè)在一些領域已有自主知識產權（如蛋白質工程）,，可望通過自主研發(fā)實現(xiàn)跨越。第四,，由于國際生物行業(yè)的全面緊縮,，只有1/7左右的生物技術研究機構是盈利的，我們有機會選擇在國外兼并一些研究所或小的高技術公司,，縮短技術發(fā)展路徑,，實現(xiàn)跨越式發(fā)展。第五,，生物制藥行業(yè)本身在國際上沒有形成統(tǒng)一的行業(yè)標準，進入壁壘較低,，使得上海市生物制藥產業(yè)在一定程度上獲得了與國際上該產業(yè)平等的發(fā)展機會和競爭地位,。
上海市生物制藥產業(yè)技術跨越模式，總體上應從合作創(chuàng)新方式為起點,，在實施的過程中有選擇地引進關鍵性或前沿性,、尖端或實驗室技術，并有選擇地并購一些發(fā)達國家相關領域的高科技小公司,，以便迅速獲得技術能力的提高,，當達到一定的技術積累后，開始實施自主—跨越模式,，最終實現(xiàn)技術跨越之目標,。
