國M.D安德森（Anderson）癌癥中心戈登·米爾斯（Gordon Mills）教授在演說伊始特別指出,，“關(guān)于個體化醫(yī)療的概念,，人們常解釋為‘在正確的時間（right time）給予正確的患者正確的治療’,，而我在此想將‘正確的時間’改為‘第一次（first time,，即首次治療時）’”,。生物標志物指導下的靶向治療,，使人們對腫瘤的個體化醫(yī)療寄予厚望,，但同時也要面對多重挑戰(zhàn)。
患者及腫瘤 由于患者基因構(gòu)成不同,，劑量,、毒性,、藥物基因組學等方面都有差異，因此需個體化衡量,。
另一方面是腫瘤異質(zhì)性的問題,，原發(fā)腫瘤的基因變異并不能反映復發(fā)或轉(zhuǎn)移灶的基因變異情況，且每個腫瘤都可能含有多種重要的亞克隆,，如果不能識別所有亞克隆的特征,，我們可能僅在管理腫瘤的一個亞群，而實際上消除了優(yōu)勢克?。╠ominant clone）后可能允許一種更具侵襲性的亞克隆生長起來,。這是否意味著需要對所有的轉(zhuǎn)移或復發(fā)灶進行活檢以鑒定基因組特征？這無疑將大幅增加費用及與重復活檢相關(guān)的并發(fā)癥,。另外,，目前最佳的測序深度，在達到70％真陽性率的同時也有30%的假陽性率結(jié)果,，對于患者管理來說,，該結(jié)果是不能接受的。
第三方面是耐藥性的問題,，幾乎在所有的病例中,，都過快地出現(xiàn)了對靶向治療的耐藥問題，這可能是由于分子分析中的錯誤,、最初假設(shè)不正確以及腫瘤異質(zhì)性等因素造成的,。在這種情況下，人們嘗試制定合理的聯(lián)合治療策略,，但也面臨著增加成本、增加毒性等挑戰(zhàn),，并且在多個藥廠間合作進行臨床試驗也有難度,。
技術(shù) 首先，顯露的大部分畸變可能只是“乘客”（基因組不穩(wěn)定和DNA修復畸變的結(jié)果）而非“司機”（決定腫瘤的行為）,，但如何區(qū)分兩者尚存問題,。其次，對暴露的大部分“司機”是無法采取行動的,，因為無法用藥物控制或不知該用哪種藥物,。再次是費用問題，目前已可能用低于1萬美元的費用測序人類基因組,，但這1萬元并不包括生物信息學分析及數(shù)據(jù)存儲和處理的費用,。實際上，據(jù)估算,，最終1000元的基因組將耗資10萬元去管理和解釋,。
倫理和監(jiān)管 這包括FDA審批,、醫(yī)生及患者教育、給患者虛擬的希望等等,。
因此,，雖然人們想著個體化治療時興奮不已，但這種興奮很容易被巨大的壓力所平復,，因為取得成功的次數(shù)（往往是短暫的）遠遠不及壯觀的失敗次數(shù),，而且在僅僅輕微改善一小部分患者轉(zhuǎn)歸的現(xiàn)狀下，個體化治療伴隨的巨額成本將成為醫(yī)療系統(tǒng)的巨大負擔,?？梢姡覀冞€遠未克服這重重障礙,。(生物谷 Bioon.com)
