本報(bào)訊 (記者劉傳書)深圳華大基因研究院和臺(tái)灣長庚大學(xué)科學(xué)家研發(fā)了一種對人類轉(zhuǎn)錄組中的RNA編輯位點(diǎn)進(jìn)行測定和分析的新型計(jì)算方法,,并發(fā)現(xiàn)人類轉(zhuǎn)錄組中存在大量的RNA編輯現(xiàn)象,該成果2月12日在國際著名期刊《自然·生物技術(shù)》上在線發(fā)表,,對進(jìn)一步了解RNA編輯與人類發(fā)育及疾病等不同生理狀態(tài)的關(guān)系具有重要作用。
RNA編輯是指DNA轉(zhuǎn)錄成RNA前體(pre-RNA)后,,RNA序列內(nèi)一些特異位點(diǎn)的核苷酸發(fā)生刪除,、添加或修飾等變化,,使得RNA所攜帶的遺傳信息發(fā)生改變的過程。準(zhǔn)確全面地對RNA編輯位點(diǎn)的鑒定和分析是深入理解轉(zhuǎn)錄后修飾相關(guān)機(jī)制等方面研究的關(guān)鍵一步,。
去年,,美國科學(xué)家發(fā)現(xiàn)大量RNA與其模板DNA序列不一致,在外顯子中發(fā)現(xiàn)了超過1萬個(gè)不同位點(diǎn),,表明在遺傳信息從細(xì)胞DNA攜帶至蛋白質(zhì)加工廠的過程中以某種未知的RNA編輯機(jī)制進(jìn)行重新編輯,,并且編輯發(fā)生的普遍性遠(yuǎn)超出原有認(rèn)識。如果這一研究發(fā)現(xiàn)被證實(shí),,將會(huì)導(dǎo)致分子生物學(xué)中的“遺傳中心法則”被改寫,。
然而,一些科學(xué)家認(rèn)為部分RNA和DNA不一致的位點(diǎn)有可能是測序時(shí)的系統(tǒng)誤差或分析方法不嚴(yán)謹(jǐn)導(dǎo)致的假陽性,。為此,,華大基因的科學(xué)家研發(fā)了更加嚴(yán)謹(jǐn)?shù)乃惴ń獯鹳|(zhì)疑,對進(jìn)一步研究帶來極大的幫助,。他們采用新技術(shù)對已有全基因組測序“炎黃一號”樣本的類淋巴細(xì)胞系進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序,。通過比較分析,共鑒定出22688個(gè)RNA編輯位點(diǎn),,其中有21113個(gè)位點(diǎn)是由腺嘌呤轉(zhuǎn)變?yōu)轼B嘌呤,;有1146個(gè)是單堿基之間的轉(zhuǎn)換;還有429個(gè)位點(diǎn)發(fā)生了單堿基顛換,。