據(jù)英國《自然》雜志近日在線發(fā)表的一項腫瘤學研究,,美國科學家團隊對數(shù)千種BRCA1基因變異按功能進行了前所未有的精確分類,報告了BRCA1基因變異的致癌風險分析結(jié)果,。這次“功能評分”,對篩查乳腺癌和卵巢癌患病風險的基因檢測解讀具有臨床意義。
BRCA1是一種人體腫瘤抑制基因,,負責維持細胞基因組的穩(wěn)定性,防止調(diào)控細胞增殖和腫瘤生長的基因突變發(fā)生積累,。而BRCA1失去功能的突變,,被認為與易患早發(fā)型乳腺癌和卵巢癌有關(guān)。截至目前,,雖然已發(fā)現(xiàn)的BRCA1基因變異有數(shù)千種,,但許多都被列為“意義未明的變異”,給人類患癌風險的評估帶來了巨大挑戰(zhàn),。
要弄清這些意義未明的變異,,其中一個方法是檢測變異基因的表達是否具有恢復DNA修復的功能,這也是腫瘤抑制過程的一部分,。鑒于此,,華盛頓大學研究人員杰·申德魯及同事,運用基因組編輯技術(shù),,對BRCA1基因功能至關(guān)重要的13個外顯子上的近4000種單核苷酸變異(SNV)的功能進行了評估,,并在2000萬個人類單倍體(HAP1)細胞中進行了后續(xù)細胞存活率測定,。
最后,研究團隊識別出了約300種會干擾表達的SNV以及400多種錯義突變的SNV(會導致蛋白質(zhì)的氨基酸序列改變),,發(fā)現(xiàn)這些變異并無實際功能(不破壞基因的原有功能),。這些功能評分與已知的致病性變異或良性變異的臨床評估密切相關(guān)。
研究人員指出,,與其他細胞系相比,,HAP1細胞系可能不是生理學上的最優(yōu)模型,但與臨床評估的高度相關(guān)性驗證了數(shù)據(jù),。美國國家癌癥研究所科學家肯定了“功能評分”對變異分類的重要價值,,并認為研究結(jié)果可直接應用于BRCA1基因篩查的解讀。