2萬多個(gè)人類基因能編碼多少蛋白質(zhì)

發(fā)布日期：2019-05-01 17:14:57 瀏覽次數(shù)：543 評(píng)論：0

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本報(bào)訊人類基因組編碼的蛋白質(zhì)數(shù)量不少于20萬個(gè),。上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院韋朝春副教授領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì),，通過DNA序列并結(jié)合其他證據(jù)預(yù)測(cè)人類基因組蛋白質(zhì)得出上述結(jié)論。以博士研究生胡智強(qiáng)

  本報(bào)訊（記者胡德榮）人類基因組編碼的蛋白質(zhì)數(shù)量不少于20萬個(gè),。上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院韋朝春副教授領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì),，通過DNA序列并結(jié)合其他證據(jù)預(yù)測(cè)人類基因組蛋白質(zhì)得出上述結(jié)論,。以博士研究生胡智強(qiáng)為第一作者的相關(guān)學(xué)術(shù)論文,，日前在線發(fā)表于《自然》系列刊物《科學(xué)報(bào)告》上,。專家認(rèn)為,，該研究提高了對(duì)基因組復(fù)雜性的理解,，為生物醫(yī)學(xué)研究提供了更完整的人類參考基因組注釋,。
  據(jù)介紹,，目前人們已經(jīng)知道能夠編碼蛋白質(zhì)的人類基因數(shù)量是2萬多個(gè),，但由于可變剪切機(jī)制,，同一個(gè)基因可以表達(dá)成多個(gè)不同的蛋白質(zhì),，這2萬多個(gè)人類基因究竟能編碼多少個(gè)蛋白質(zhì)目前仍是個(gè)謎。雖然各種高通量測(cè)序方法進(jìn)展飛速,，但很多蛋白質(zhì)只在特定組織,、一定的發(fā)育階段或者特定條件下才表達(dá)，因此通過實(shí)驗(yàn)的方法檢測(cè)人類所有蛋白質(zhì),，在目前技術(shù)條件下幾乎不可能,。然而,，從人類基因組序列直接預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)序列的方法可以避免這個(gè)缺陷。
  韋朝春研究團(tuán)隊(duì)首先開發(fā)了一個(gè)直接從基因組序列從頭預(yù)測(cè)可變剪切的方法,，結(jié)合現(xiàn)有的海量基因表達(dá)數(shù)據(jù),，包括轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)，找到了約3萬個(gè)現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中沒有的蛋白質(zhì)序列,。隨機(jī)抽樣并設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證表明,，約85%的預(yù)測(cè)結(jié)果可以得到實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。這些蛋白質(zhì)序列使現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中完整的蛋白質(zhì)序列數(shù)量增加到約9萬個(gè),。和公共數(shù)據(jù)庫中已有的蛋白質(zhì)相比,，這些新發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)的表達(dá)具有更高的組織特異性，表達(dá)量相對(duì)較低,，因而也更難被發(fā)現(xiàn),。根據(jù)這些結(jié)果，科研人員預(yù)測(cè)人類基因組編碼的蛋白質(zhì)數(shù)量不少于20萬個(gè),。
  澳大利亞阿德萊德大學(xué),、美國范德堡大學(xué),、中國第二軍醫(yī)大學(xué)和上海生物信息技術(shù)研究中心參與了該項(xiàng)目的合作研究,。

關(guān)鍵詞： 基因蛋白質(zhì)

(文/小編)

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