C18柱脫鹽：有人稱其為簡易反相柱,，它對DNA有特異性的吸附,，可以被有機溶解洗脫，但不會被水洗脫,，所以能有效地去除鹽分,。它不能有效去除比目的片段短的小片段。實際上,，它是一種脫鹽的作用,。這種方法一般不會對普通PCR反應產生影響。對于需要用于測序,、克隆的引物不能使用這個級別,。   
◆　OPC純化： OPC純化是根據DNA保護基（DMTr基）和Cartridge柱中樹脂間的親合力作用的原理進行純化目的DNA片段。OPC法純化的DNA純度大于95%,。適用于40mer以下引物的純化,。

◆　PAGE純：PAGE純化法是使用變性聚丙烯酰胺凝膠電泳，對DNA片段進行分離,，然后從凝膠中回收目的DNA的方法,。PAGE純化法也是一種非常有效的DNA純化方法,，純化后的DNA純度大于95%，對長鏈Oligo DNA (大于50mer)的純化特別有效,。

◆　HPLC純化：HPLC純化是使用高效液相色譜的原理,，對DNA片段進行純化。純度可以大于99%,。主要用于短鏈和修飾引物的純化,。該法的弱點是成本較高，批量生產效率不高,。