隨著越來越多的專業(yè)實驗室可信數(shù)據(jù)的出現(xiàn),，精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)正在指導(dǎo)藥物的開發(fā),，不斷接近臨床試驗的主要療效指標(biāo)正在迅速成為規(guī)則，而不是例外,。
生物標(biāo)志物(biomarker)可用來理解的作用機制(mechanisms of action,，MOA)、評價藥物的藥理作用(藥效學(xué)/藥代動力學(xué)),、解釋治療反應(yīng)的差異,，甚至在許多情況下用以篩選或區(qū)分患者。
事實上,，最近的一項研究表明：僅僅使用生物標(biāo)志物篩選患者,，使得2006年到2015年臨床開發(fā)的成功率大大提高，其中藥物被批準(zhǔn)進(jìn)行I期臨床試驗的可能性增加了3倍;從III期臨床試驗到被批準(zhǔn)的可能性增加了20%,。
因此,，越來越多的制藥公司轉(zhuǎn)向生物標(biāo)志物的研發(fā)，利用生物標(biāo)志物相關(guān)數(shù)據(jù)告知劑量選擇,、患者分層,、調(diào)整臨床試驗是全行業(yè)的共同目標(biāo)。
然而,，除非這些數(shù)據(jù)能夠迅速準(zhǔn)確地協(xié)調(diào)一致,，否則它對促進(jìn)藥物開發(fā)或批準(zhǔn)沒有任何作用。
1,、臨床試驗已經(jīng)發(fā)生變化,，尤其是腫瘤學(xué)試驗
這種協(xié)調(diào)可以是一個挑戰(zhàn)，部分原因是由于數(shù)據(jù)量的龐大,、基礎(chǔ)以及多樣性,。從歷史上看,，血液學(xué)，臨床化學(xué)和藥代動力學(xué)一直是以臨床試驗為核心,。然后,，隨著抗體療法和免疫治療的出現(xiàn)，逐漸形成以抗藥性抗體,、免疫監(jiān)測點及其他細(xì)胞檢測為開心的開發(fā)思路,。
現(xiàn)代醫(yī)學(xué)進(jìn)一步將生物標(biāo)志物評估納入疾病診斷和治療決策。而這種豐富的信息無疑會推動衛(wèi)生保健事業(yè)的重要發(fā)展,，同時也在挑戰(zhàn)傳統(tǒng)腫瘤學(xué)研究的方法,。主要包括以下4個方面：
樣本檢測(Assays )本身是多種多樣的
隨著下一代測序(NGS)、液體活檢和細(xì)胞檢測等技術(shù)進(jìn)步,，一些多色流式細(xì)胞儀導(dǎo)致了從NGS,、微陣列到免疫和細(xì)胞分析等多領(lǐng)域的繁榮。此外,，一些特定樣本常被用來評估腫瘤的異質(zhì)性,，如循環(huán)腫瘤細(xì)胞(circulating tumor cells)、免疫組庫(immune repertoire),、靶向免疫細(xì)胞群(targeted immune cell populations),。
樣本檢測流程是多種多樣的
為了確保實驗室結(jié)果對下游分析是可用的，每個檢測類型具有獨特的工作流程和質(zhì)量控制參數(shù),。
涉及一系列實驗室類型
傳統(tǒng)的樣本檢測，如血液學(xué)和臨床化學(xué),，可以在中央實驗室(central labs)運行,。然而，生物標(biāo)志物檢測的多樣性需要特定的方法,、特定人員和特定的專業(yè)知識,。
因此，管理此類樣本檢測的專業(yè)化實驗室開始出現(xiàn),，他們常常開發(fā)專有技術(shù),、方法或平臺(panels)。從每一個主機中管理數(shù)據(jù)流只有專業(yè)的供應(yīng)商才能嘗試,。
癌癥生物學(xué)特別復(fù)雜
由于疾病的發(fā)病機制和腫瘤異質(zhì)性,、藥物的反應(yīng)和耐藥性以及腫瘤遺傳學(xué)和免疫系統(tǒng)的影響都有特定的、需要不斷探索和理解生物學(xué)機理,。因此,，癌癥研究人員需要執(zhí)行多個實驗，才能有效地解決這種復(fù)雜疾病中的不同分型,。
即使是成功地協(xié)調(diào)這些獨立的數(shù)據(jù)陣列,，也不能排除數(shù)據(jù)管理中面臨的挑戰(zhàn)以及失敗的風(fēng)險,。
2、數(shù)據(jù)協(xié)調(diào)至關(guān)重要
數(shù)據(jù)協(xié)調(diào)至關(guān)重要的原因有兩個：快速決策和滿足監(jiān)管要求,。在臨床腫瘤學(xué)藥物開發(fā)中,，生物標(biāo)志物經(jīng)常被用來支持/否定每個階段的試驗。倘若沒有將臨床操作與生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)緊密結(jié)合,，相關(guān)臨床決策將會被推遲,，從而影響試驗進(jìn)度，使成本上升,，批準(zhǔn)被延遲;這對目標(biāo)患者(指可能從新療法獲益的人群)的身心健康和資金提供者而言皆是不利的,。
值得一提的是，新的FDA法規(guī)進(jìn)一步擴大了危險,。根據(jù)FDA的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)目錄(FDA Data Standards Catalog ),，如今向FDA遞交的申請文件需要含有按照FDA規(guī)定格式(如CDISC、SDTM,、ADaM)的數(shù)據(jù)集,。
在某些情況下，即使生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)符合CDISC標(biāo)準(zhǔn)要求,，但他們經(jīng)常需要創(chuàng)建符合CDISC的自定義域,，以能夠鑒定出其中的細(xì)微差別;此外，分類數(shù)據(jù)無可避免會導(dǎo)致提交和批準(zhǔn)的延誤,。
3,、傳統(tǒng)協(xié)調(diào)方法無法滿足當(dāng)下數(shù)據(jù)需求
沒有生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)的臨床試驗只能算是傳統(tǒng)的工作流程，一般由發(fā)起者或者合同研究組織(CRO)進(jìn)行試驗數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計學(xué)分析,。然而,，發(fā)起者可能快速地將生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)匹配特殊需求，而是通過獨立的工作流程,，將責(zé)任落到轉(zhuǎn)化研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)小組及臨床試驗團(tuán)隊中,。
此外，遠(yuǎn)程生成的數(shù)據(jù)通常在臨床試驗數(shù)據(jù)庫管理之外,。每個專業(yè)實驗室供應(yīng)商將其生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)傳遞給發(fā)起者,。每個單獨的實驗室往往采用自己的格式，否則需要特殊安排和增加費用,，以符合發(fā)起者規(guī)定的格式,。因此，每個生物標(biāo)記數(shù)據(jù)類型需要單獨的工作流,。這些工作流程可能需要幾周甚至幾個月的時間來整合;更糟的是,，他們可能永遠(yuǎn)不會被整合。
委婉地說,，這種情況是不可能產(chǎn)生理想的分析和報告,。因此,，傳統(tǒng)協(xié)調(diào)方法無法滿足當(dāng)下數(shù)據(jù)需求，我們迫切需要迅速,、準(zhǔn)確地協(xié)調(diào)不同的數(shù)據(jù)集,。
4、關(guān)鍵是深度,、多樣化且專業(yè)化的技術(shù)知識
有些人可能會覺得僅使用超級計算機或技術(shù)就可以提供一個透明的解決方案來應(yīng)對協(xié)調(diào)的挑戰(zhàn),。
事實上并非如此，核心問題不是計算能力,，而是專業(yè)知識,。從需要整合、協(xié)調(diào)及報告的多種專業(yè)化實驗室到數(shù)據(jù)格式,，這需要進(jìn)行多樣化的生物檢測,。
其次，所有這一切必須發(fā)生在臨床試驗的背景下,，所有的可操作板塊必須按照嚴(yán)格的時間點進(jìn)行審查,、分析和決策。
當(dāng)然,，技術(shù)是有用的,。但它需要擁有現(xiàn)代生物標(biāo)志物檢測的廣度和深度的專家團(tuán)隊;能夠?qū)鹘y(tǒng)標(biāo)準(zhǔn)和流程應(yīng)用于專業(yè)實驗室數(shù)據(jù)管理的專業(yè)人士;可以設(shè)計、驗證和解決生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)管理問題的創(chuàng)新數(shù)據(jù)科學(xué)家,。
只有在上述基礎(chǔ)上建立專業(yè)知識,、操作規(guī)范使用流程以及安全的IT基礎(chǔ)設(shè)施，才能保住臨床試驗的開發(fā),。最最重要的,，還必須有一個有效的技術(shù)平臺，提供生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)的集中式訪問,、安全數(shù)據(jù)傳輸、數(shù)據(jù)集成和協(xié)作以及交互式報告?，F(xiàn)實中這種整合和可視化生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)的能力,，需要通過用戶友好、基于Web的工具將允許發(fā)起者從所有的數(shù)據(jù)源中收獲重要知識,，從而,，更好地知曉臨床試驗評估效果。
5,、有效的數(shù)據(jù)管理對于滿足主要療效指標(biāo)至關(guān)重要
無效管理會導(dǎo)致失敗,。在現(xiàn)代臨床試驗中，實時生成,、跟蹤和協(xié)調(diào)生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)并及時決策是關(guān)鍵,。主要目標(biāo)包括：劑量發(fā)現(xiàn),、病人分層以及通過生物標(biāo)志物指導(dǎo)匹配試驗，這種解決方案最終將產(chǎn)生更多有針對性的試驗結(jié)果,、縮短試驗時間,、提高研發(fā)效率和降低成本。
這些結(jié)果太重要了,，不能冒險,。
原始出處：
Scott Marshall, Jared Kohler.The Challenges of Harmonizing Biomarker Data.GEN Exclusives.February 20, 2017
