新發(fā)傳染病嚴重威脅人類健康,，危害國家經(jīng)濟建設(shè)與社會穩(wěn)定,，如何有效預(yù)防新發(fā)傳染病在易感人群中傳播是人類面臨的重大挑戰(zhàn)。復(fù)旦大學(xué)4日披露,，上海市公共衛(wèi)生臨床中心,、復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院徐建青教授課題組和同濟大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院曹志偉教授課題組合作研發(fā)了一個新的病原體抗原性計算平臺。
據(jù)悉,，利用疫苗預(yù)防傳染病是最有效,、最經(jīng)濟的手段，但傳統(tǒng)疫苗研發(fā)手段投入大,、耗時長,，給及時阻止新發(fā)傳染病播散帶來嚴重挑戰(zhàn)。課題組方面表示,，如何利用現(xiàn)有的疫苗或設(shè)計廣譜抗病毒疫苗來預(yù)防新發(fā)病毒性傳染病是最值得探索的手段,，其核心技術(shù)問題與挑戰(zhàn)是如何快速的篩選或者設(shè)計能夠針對同類病毒甚至不同病毒具有交叉保護作用的疫苗免疫原。
研究人員設(shè)計了一個空間免疫表位比對工具CE-BLAST,，以高效計算不同病原體之間的抗原性距離,。與以往的計算方法相比，CE-BLAST最大的優(yōu)勢在于可以不需要借助于實驗數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練來構(gòu)建模型,，這對于一些還缺少實驗數(shù)據(jù)的新病原體而言以及新爆發(fā)的傳染性疾病(例如寨卡病毒)而言尤為關(guān)鍵,。
研究成果新近以《CE-BLAST:一種計算新發(fā)傳染病病原體抗原性相似度的新型平臺》為題在線發(fā)表于《自然·通訊》。
據(jù)介紹,，研究人員在病毒亞型內(nèi)不同毒株間(甲型流感病毒H3N2亞型),，病毒不同亞型之間(登革病毒不同血清型)，跨病毒(黃病毒科登革病毒及寨卡病毒)這三個層面上依次驗證了方法的有效性,。
研究人員還利用CE-BLAST構(gòu)建出了一株廣譜抗甲型流感病毒H3N2亞型不同毒株的疫苗,，并在動物實驗上得到很好的保護譜范圍。研究表明,，該方法有望設(shè)計出針對新發(fā)病毒具有交叉保護作用的新型疫苗,。
據(jù)介紹,，有趣的是，本方法計算出寨卡與登革熱病毒存在高度相似的抗體表位,，現(xiàn)有的登革熱疫苗有潛在交叉預(yù)防寨卡病毒的作用,，而這一預(yù)測已被領(lǐng)域內(nèi)其他實驗室的動物研究所證實。
原始出處：
Tianyi Qiu, Yiyan Yang, Jingxuan Qiu, et.al.CE-BLAST makes it possible to compute antigenic similarity for newly emerging pathogens.Nature Communications 02 May 2018
