公立醫(yī)院的改革是醫(yī)改的重點。在公立醫(yī)院規(guī)劃布局調(diào)整上,，《安排》指出要將區(qū)域內(nèi)各級各類醫(yī)療機構(gòu)統(tǒng)一納入規(guī)劃,，每千常住人口醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)床位數(shù)達到4張的，原則上不再擴大公立醫(yī)院規(guī)模,。除了看病難,，藥價高也是備受關(guān)注的醫(yī)改難題。《安排》要求,，取消藥品加成政策，建立科學(xué)補償機制,，破除以藥補醫(yī),。醫(yī)院因藥品零差率銷售減少的合理收入的80%通過調(diào)整醫(yī)療服務(wù)價格補償，20%由各級財政予以補償,。

此外,，縣級公立醫(yī)院使用的藥品（不含中藥飲片）及高值耗材，要依托省級集中采購平臺,，以省為單位,，采取招采合一、量價掛鉤等辦法開展集中招標采購,，增強醫(yī)療機構(gòu)在招標采購中的參與度,，積極探索進一步降低采購價格的有效途徑?！栋才拧芬笸苿庸⑨t(yī)院去行政化,，逐步取消公立醫(yī)院行政級別。到2014年年底,，衛(wèi)生計生行政部門負責人一律不得兼任公立醫(yī)院領(lǐng)導(dǎo)職務(wù),。

根據(jù)《安排》，2014年職工基本醫(yī)療保險,、城鎮(zhèn)居民基本醫(yī)療保險（以下統(tǒng)稱城鎮(zhèn)居民醫(yī)保）和新型農(nóng)村合作醫(yī)療（以下簡稱新農(nóng)合）三項基本醫(yī)保參保（合）率穩(wěn)定在95%以上,，城鎮(zhèn)居民醫(yī)保和新農(nóng)合人均政府補助標準提高40元，達到320元,；個人繳費同步新增20元,。城鎮(zhèn)居民醫(yī)保和新農(nóng)合政策范圍內(nèi)住院費用支付比例分別達到70%以上和75%左右，進一步縮小與實際住院費用支付比例之間的差距,。