從植物中萃取食品添加劑的成本高,，且來源有限，化學合成法生產食品添加劑雖成本低,，但化學合成率低,，周期長且可能危害人體健康。因此,，生物技術,，尤其是發(fā)酵工程技術已成為食品添加劑生產的首選方法,。目前，利用微生物技術發(fā)酵生產的食品添加劑主要有維生素(ＶＣ,、ＶＢ１２,、ＶＢ２)、甜味劑,、增香劑和色素等產品,。發(fā)酵工程生產的天然色素、天然新型香味劑,，正在逐步取代人工合成的色素和香精,，這也是現(xiàn)今食品添加劑研究的方向。
氨基酸生產過去都是采用動植物蛋白質提取和化學合成法生產,，而采用基因工程和細胞融合技術生成的“工程酶”進行發(fā)酵,，其生產成本下降、污染減少,，產量可成倍增加,。
食品色素
紅曲色素 以大米為原料，利用紅曲霉發(fā)酵生產紅曲色素,，這是目前最廉價的純天然食用色素,。武漢佳成生物公司將液態(tài)發(fā)酵和固態(tài)發(fā)酵相結合，生產出的紅曲色素色價可達到６０００ｕ／ｇ,。
蝦青素 蝦青素可由紅發(fā)夫酵母發(fā)酵后分離,、提取制得。它有極強的抗氧化性能,，具有抑制腫瘤,、增強免疫力等保健功能。
類胡蘿卜素 可利用三抱布拉霉和紅酵母發(fā)酵后,，分離,、提取生產類胡蘿卜素。
味精 使用雙酶法糖化發(fā)酵工藝取代傳統(tǒng)的酸法水解工藝,，可提高原料利用率１０％左右,，已廣泛應用于味精生產。
己酸菌 以現(xiàn)代發(fā)酵工程改造傳統(tǒng)發(fā)酵工藝,，武漢佳成生物有限公司生產的己酸菌含量已達到５億／ｍｏｌ,，比傳統(tǒng)發(fā)酵工藝高近１０倍。
細菌發(fā)酵生產酒精
多年來人們—直用酵母發(fā)酵生產酒精,，近年來廣泛研究了細菌發(fā)酵生產酒精以期得到耐高溫,、耐酒精的新菌種,。
調味品的純種和復合菌種發(fā)酵
日本利用純種曲霉進行醬油釀造,，原料的蛋白質利用率高達８５％,。武漢佳成生物有限公司研發(fā)的復合曲種，應用于醬油,、醋,、黃酒、豆腐乳等發(fā)酵生產,，提高了原料利用率,，縮短了發(fā)酵周期，改良風味和品質得到了顯著成效,。
細胞蛋白(SCP)的生產
由于微生物菌體的蛋白質含量高,，—般細菌含蛋白質６０％—７０％，酵母４５％—６５％,，霉菌３５％—４０％,。因此，它是一種理想的蛋白質資源,。為了和來源于植物,、動物蛋白相區(qū)別，人們把微生物蛋白稱作為單細胞蛋白(Ｓｏｌｅ Ｃｅｌｌ Ｐｒｏｔｅｉｎ,，ＳＣＰ),。前蘇聯(lián)利用發(fā)酵法大量生產酵母，最高產量曾達到６０萬噸／年,，成為世界上最大的單細胞蛋白生產國,。由于生產ＳＣＰ的微生物以酵母和藻類為主，也有采用細菌,、放線菌和絲狀真菌的,，但現(xiàn)在許多國家都在積極進行球藻和螺旋藻ＳＣＰ開發(fā)，如美國,、日本,、墨西哥等國所生產的螺旋藻食品既是高級營養(yǎng)品，也是減肥產品,，在國際上很受歡迎,。科學家們設計了分泌蛋白質的微生物,，由“工程酶”(大腸桿菌和酵母菌)發(fā)酵生產了高營養(yǎng)強化蛋氨酸的大豆球朊和雞卵清蛋白,。
