柯達全自動洗片機用于Western實驗
Western,,也稱Western blot,、Western blotting,、Western印跡,,是用抗體檢測蛋白的重要方法之一,。Western可以參考如下步驟進行操作。
1.
收集蛋白樣品(Protein sample preparation)
Ø 可以使用適當?shù)牧呀庖?,例如碧云天生產(chǎn)的Western及IP細胞裂解液(P0013),、RIPA裂解液等,裂解貼壁細胞,、懸浮細胞或組織
樣品,。對于某些特定的亞細胞組份蛋白,例如細胞核蛋白,、細胞漿蛋白,、線粒體蛋白等,可以參考相關(guān)文獻提取這些亞細胞組份
蛋白,,也可以使用試劑盒進行抽提,,例如碧云天生產(chǎn)的細胞核蛋白與細胞漿蛋白抽提試劑盒(P0028)。
Ø 收集完蛋白樣品后,為確保每個蛋白樣品的上樣量一致,,需要測定每個蛋白樣品的蛋白濃度,。根據(jù)所使用的裂解液的不同,需要
采用適當?shù)牡鞍诐舛葴y定方法,。因為不同的蛋白濃度測定方法對于一些去垢劑和還原劑等的兼容性差別很大,。如果使用碧云天生
產(chǎn)的Western及IP細胞裂解液或RIPA裂解液,可以使用BCA蛋白濃度測定試劑盒(P0009/P0010/P0011/P0012),。
2. 電泳(Electrophoresis)
(1) SDS-PAGE凝膠配制
Ø SDS-PAGE凝膠可以參考一些文獻資料進行配制,,也可以使用碧云天生產(chǎn)的SDS-PAGE凝膠配制試劑盒(P0012A)。該試劑盒提供了
除水和配膠器具外的所有試劑以及配制各種濃度SDS-PAGE的配方,。
(2) 樣品處理
Ø 在收集的蛋白樣品中加入適量濃縮的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液,。例如2X或5X的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液。使用5X的SDS-PAGE蛋
白上樣緩沖液可以減小上樣體積,,在相同體積的上樣孔內(nèi)可以上樣更多的蛋白樣品,。5X的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液可以參考相關(guān)文獻資料配制,也可以使用碧云天生產(chǎn)的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液(5X)(P0015),。
Ø 100℃或沸水浴加熱3-5分鐘,,以充分變性蛋白。
(3) 上樣與電泳
Ø 冷卻到室溫后,,把蛋白樣品直接上樣到SDS-PAGE膠加樣孔內(nèi)即可,。
Ø 為了便于觀察電泳效果和轉(zhuǎn)膜效果,以及判斷蛋白分子量大小,,最好使用預染蛋白質(zhì)分子量標準(P0066),。
Ø 電泳時電泳液可以使用碧云天生產(chǎn)的SDS-PAGE電泳液(P0014A/P0014B)。
Ø 電泳時通常推薦在上層膠時使用低電壓恒壓電泳,,而在溴酚藍進入下層膠時使用高電壓恒壓電泳,。對于Bio-Rad的標準電泳裝置
或類似電泳裝置,低電壓可以設置在80-100V,,高電壓可以設置在120V左右,。SDS-PAGE可以采用普通的電泳儀就可以滿足要求,
也可以采用碧云天的多功能電泳儀(帶定時)(EEP102),。為了電泳方便起見,,也可以采用整個SDS-PAGE過程恒壓的方式,通常把
電壓設置在100V,,然后設定定時時間為90-120分鐘,。設置定時可以避免經(jīng)常發(fā)生的電泳過頭。
Ø 通常電泳時溴酚藍到達膠的底端處附近即可停止電泳,,或者可以根據(jù)預染蛋白質(zhì)分子量標準的電泳情況,,預計目的蛋白已經(jīng)被適
當分離后即可停止電泳,。
3. 轉(zhuǎn)膜(Transfer)
Ø 我們推薦在Western實驗中選用PVDF膜(FFP30/FFP33)。硝酸纖維素膜(NC膜)(FFN06/FFN09)也可以使用,,但硝酸纖維素膜比較
脆,,在操作過程中特別是用鑷子夾取等過程中容易裂開。膜的使用請參考生產(chǎn)商的推薦使用步驟,。
Ø 通常如果使用Bio-Rad的標準濕式轉(zhuǎn)膜裝置,,可以設定轉(zhuǎn)膜電流為300-400mA,轉(zhuǎn)膜時間為30-60分鐘,。也可以在15-20mA轉(zhuǎn)膜過
夜,。轉(zhuǎn)膜時也可以使用碧云天的多功能電泳儀(帶定時)(EEP102)。具體的轉(zhuǎn)膜時間要根據(jù)目的蛋白的大小而定,,目的蛋白的分子
量越大,,需要的轉(zhuǎn)膜時間越長,目的蛋白的分子量越小,,需要的轉(zhuǎn)膜時間越短,。
Ø 在轉(zhuǎn)膜過程中,特別是高電流快速轉(zhuǎn)膜時,,通常會有非常嚴重的發(fā)熱現(xiàn)象,,最好把轉(zhuǎn)膜槽放置在冰浴中進行轉(zhuǎn)膜。
Ø 轉(zhuǎn)膜的效果可以觀察所使用的預染蛋白質(zhì)分子量標準,,通常分子量最大的1-2條帶較難全部轉(zhuǎn)到膜上,。轉(zhuǎn)膜的效果也可以用麗春
紅染色液(P0022)對膜進行染色,以觀察實際的轉(zhuǎn)膜效果,。也可以用考馬斯亮藍快速染色液(P0017)對完成轉(zhuǎn)膜的SDS-PAGE膠進
行染色,,以觀察蛋白的殘留情況。
4. 封閉(Blocking)
Ø 轉(zhuǎn)膜完畢后,,立即把蛋白膜放置到預先準備好的Western洗滌液(P0023C)中,,漂洗1-2分鐘,以洗去膜上的轉(zhuǎn)膜液,。從轉(zhuǎn)膜完畢
后所有的步驟,,一定要注意膜的保濕,,避免膜的干燥,,否則極易產(chǎn)生較高的背景。
Ø 用微型臺式真空泵(EVAC06/EVAC07)或滴管等吸盡洗滌液,,加入Western封閉液(P0023B),,在搖床上緩慢搖動,室溫封閉60分鐘
。對于一些背景較高的抗體,,可以4℃封閉過夜,。在整個Western過程中我們推薦使用碧云天的側(cè)擺搖床(ESHK02)或類似儀器,,側(cè)向擺動速度比較緩慢,而且也容易讓溶液覆蓋蛋白膜,。
5. 一抗孵育(Primary antibody incubation)
Ø 參考一抗的說明書,,按照適當比例用Western一抗稀釋液(P0023A)稀釋一抗。
Ø 用微型臺式真空泵或滴管等吸盡封閉液,,立即加入稀釋好的一抗,,室溫或4℃在側(cè)擺搖床上緩慢搖動孵育一小時。如果一抗孵育一
小時效果不佳,,可以4℃緩慢搖動孵育過夜,。或更據(jù)抗體的說明選擇適當?shù)姆跤郎囟群蜁r間,。
Ø 回收一抗,。加入Western洗滌液(P0023C),在側(cè)擺搖床上緩慢搖動洗滌5-10分鐘,。吸盡洗滌液后,,再加入洗滌液洗滌5-10分鐘。
共洗滌3次,。如果結(jié)果背景較高可以適當延長洗滌時間并增加洗滌次數(shù),。
注:Western結(jié)果通常需要提供內(nèi)參作為對照,通??梢赃x用Tubulin抗體(AT819)或Actin抗體(AA128),,進行內(nèi)參檢測。
6. 二抗孵育(Secondary antibody inucubation)
Ø 參考二抗的說明書,,按照適當比例用Western二抗稀釋液(P0023D)稀釋辣根過氧化物酶(HRP)標記的二抗,。 二抗需根據(jù)一抗進行
選擇,例如,,一抗是小鼠來源的IgG,,則二抗需選擇抗小鼠IgG的二抗,如辣根過氧化物酶標記山羊抗小鼠IgG(H+L)(A0216),。碧云天有多種二抗提供,。
Ø 用微型臺式真空泵或滴管等吸盡洗滌液,立即加入稀釋好的二抗,,室溫或4℃在側(cè)擺搖床上緩慢搖動孵育一小時,。
Ø 回收二抗。加入Western洗滌液(P0023C),,在側(cè)擺搖床上緩慢搖動洗滌5-10分鐘,。吸盡洗滌液后,再加入洗滌液洗滌5-10分鐘,。
共洗滌3次,。如果結(jié)果背景較高可以適當延長洗滌時間并增加洗滌次數(shù),。
7. 蛋白檢測(Detection of proteins)
Ø 參考相關(guān)說明書,使用BeyoECL Plus(P0018)等ECL類試劑來檢測蛋白,。壓片可以采用專用的壓片暗盒(FFC58/FFC83)進行,。
Ø 洗片時可以使用X光片自動洗片機。如果沒有自動洗片機,,可以用顯影定影試劑盒(P0019/P0020)自行配制顯影液和定影液進行手
工洗片,。X光片推薦選用柯達原裝的生物實驗專用柯達X-OMAT BT膠片(FF057/FF081)。
8. 膜的重復利用(Membrane recovery)
Ø 如果蛋白樣品非常寶貴,,可以使用Western一抗二抗去除液(P0025)處理蛋白膜,,以重復利用蛋白膜。
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