2020年5月27日訊 /生物谷BIOON /——決策者和公眾一直在爭(zhēng)論導(dǎo)致COVID-19的SARS-CoV-2病毒的來(lái)源,。盡管研究人員認(rèn)為蝙蝠最有可能是SARS-CoV-2的自然宿主,,但這種病毒的起源仍不清楚。近日在Current Biology雜志上,,研究人員描述了一個(gè)最近發(fā)現(xiàn)的與SARS-CoV-2的某些基因組區(qū)域高度相似的蝙蝠冠狀病毒的基因組,,其刺突蛋白的亞基S1和S2的連接處包含與SARS-CoV-2高度相似的氨基酸插入。研究人員說(shuō),,雖然它不是SARS-CoV-2的直接進(jìn)化前體,,但這種名為RmYN02的新病毒表明,這些看似不尋常的插入事件可以在冠狀病毒進(jìn)化過(guò)程中自然發(fā)生,。
圖片來(lái)源:https://cn.bing.com
"自從SARS-CoV-2被發(fā)現(xiàn)以來(lái),,已經(jīng)有許多毫無(wú)根據(jù)的猜測(cè)認(rèn)為該病毒來(lái)源于有實(shí)驗(yàn)室,,"中國(guó)山東第一醫(yī)科大學(xué)病原生物學(xué)研究所主任、資深作者Weifeng Shi說(shuō),。"特別是,有人提出S1/S2插入是非常不尋常的,,可能是實(shí)驗(yàn)室操作的跡象,。我們的論文非常清楚地表明,這些事件在野生動(dòng)物中是自然發(fā)生的,。這提供了強(qiáng)有力的證據(jù),,證明SARS-CoV-2并非實(shí)驗(yàn)室來(lái)源的。"
研究人員通過(guò)分析2019年5月至10月在中國(guó)云南省收集的227個(gè)蝙蝠樣本,,確定了RmYN02,。"自從2005年發(fā)現(xiàn)蝙蝠是SARS冠狀病毒的宿主以來(lái),人們就對(duì)蝙蝠作為傳染病的宿主物種產(chǎn)生了極大的興趣,,特別是因?yàn)樗鼈償y帶了非常豐富的RNA病毒,,包括冠狀病毒。"2020年1月初,,在發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2后不久,,來(lái)自樣本的RNA被送往宏基因組下一代測(cè)序。
在整個(gè)基因組中,,與SARS-CoV-2最接近的病毒是另一種病毒,,稱為RaTG13,此前在云南省的蝙蝠中發(fā)現(xiàn),。但在這里新發(fā)現(xiàn)的RmYN02病毒與SARS-CoV-2的關(guān)系更為密切,,它與SARS-CoV-2在基因組的某些部分有更密切的關(guān)系,包括在基因組最長(zhǎng)的編碼段1ab中,,它們共享97.2%的RNA,。研究人員注意到,RmYN02在基因組中編碼關(guān)鍵受體結(jié)合域的區(qū)域與SARS-CoV-2用來(lái)感染宿主細(xì)胞的人類(lèi)ACE2受體結(jié)合的區(qū)域并不十分相似,。這意味著它不太可能感染人類(lèi)細(xì)胞,。
SARS-CoV-2和RmYN02之間的關(guān)鍵相似之處在于,RmYN02在其穗狀蛋白的兩個(gè)亞基連接的地方也含有相似的氨基酸插入,。SARS-CoV-2的特征是在S1和S2的交界處插入一個(gè)四氨基酸序列,;這種插入是該病毒特有的,迄今已在所有SARS-CoV-2序列中出現(xiàn),。RmYN02中的插入與SARS-CoV-2中的不一樣,,這表明它們是通過(guò)獨(dú)立的插入事件發(fā)生的。但是,,在蝙蝠身上發(fā)現(xiàn)的一種病毒中也發(fā)生了類(lèi)似的插入事件,,這有力地表明,,這類(lèi)插入是自然發(fā)生的。"我們的研究結(jié)果表明,,這些最初看起來(lái)非常不尋常的插入事件,,實(shí)際上可以自然地發(fā)生在動(dòng)物的beta冠狀病毒中。"
"我們的工作進(jìn)一步揭示了SARS-CoV-2的進(jìn)化祖先,,"他補(bǔ)充說(shuō),。"無(wú)論是RaTG13還是RmYN02都不是SARS-CoV-2的直接祖先,因?yàn)樵谶@些病毒之間仍然存在著進(jìn)化差距,。但我們的研究有力地表明,,對(duì)更多野生物種的采樣將揭示與SARS-CoV-2甚至其直系祖先關(guān)系更密切的病毒,這將告訴我們關(guān)于這種病毒如何在人類(lèi)中出現(xiàn)的大量信息,。"(生物谷Bioon.com)
參考資料:
A close relative of SARS-CoV-2 found in bats offers more evidence it evolved naturally
Hong Zhou et al,, A novel bat coronavirus closely related to SARS-CoV-2 contains natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the spike protein, Current Biology (2020). DOI: 10.1016/j.cub.2020.05.023(潤(rùn)寶醫(yī)療網(wǎng))

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"自從SARS-CoV-2被發(fā)現(xiàn)以來(lái),,已經(jīng)有許多毫無(wú)根據(jù)的猜測(cè)認(rèn)為該病毒來(lái)源于有實(shí)驗(yàn)室,,"中國(guó)山東第一醫(yī)科大學(xué)病原生物學(xué)研究所主任、資深作者Weifeng Shi說(shuō),。"特別是,有人提出S1/S2插入是非常不尋常的,,可能是實(shí)驗(yàn)室操作的跡象,。我們的論文非常清楚地表明,這些事件在野生動(dòng)物中是自然發(fā)生的,。這提供了強(qiáng)有力的證據(jù),,證明SARS-CoV-2并非實(shí)驗(yàn)室來(lái)源的。"
研究人員通過(guò)分析2019年5月至10月在中國(guó)云南省收集的227個(gè)蝙蝠樣本,,確定了RmYN02,。"自從2005年發(fā)現(xiàn)蝙蝠是SARS冠狀病毒的宿主以來(lái),人們就對(duì)蝙蝠作為傳染病的宿主物種產(chǎn)生了極大的興趣,,特別是因?yàn)樗鼈償y帶了非常豐富的RNA病毒,,包括冠狀病毒。"2020年1月初,,在發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2后不久,,來(lái)自樣本的RNA被送往宏基因組下一代測(cè)序。
在整個(gè)基因組中,,與SARS-CoV-2最接近的病毒是另一種病毒,,稱為RaTG13,此前在云南省的蝙蝠中發(fā)現(xiàn),。但在這里新發(fā)現(xiàn)的RmYN02病毒與SARS-CoV-2的關(guān)系更為密切,,它與SARS-CoV-2在基因組的某些部分有更密切的關(guān)系,包括在基因組最長(zhǎng)的編碼段1ab中,,它們共享97.2%的RNA,。研究人員注意到,RmYN02在基因組中編碼關(guān)鍵受體結(jié)合域的區(qū)域與SARS-CoV-2用來(lái)感染宿主細(xì)胞的人類(lèi)ACE2受體結(jié)合的區(qū)域并不十分相似,。這意味著它不太可能感染人類(lèi)細(xì)胞,。
SARS-CoV-2和RmYN02之間的關(guān)鍵相似之處在于,RmYN02在其穗狀蛋白的兩個(gè)亞基連接的地方也含有相似的氨基酸插入,。SARS-CoV-2的特征是在S1和S2的交界處插入一個(gè)四氨基酸序列,;這種插入是該病毒特有的,迄今已在所有SARS-CoV-2序列中出現(xiàn),。RmYN02中的插入與SARS-CoV-2中的不一樣,,這表明它們是通過(guò)獨(dú)立的插入事件發(fā)生的。但是,,在蝙蝠身上發(fā)現(xiàn)的一種病毒中也發(fā)生了類(lèi)似的插入事件,,這有力地表明,,這類(lèi)插入是自然發(fā)生的。"我們的研究結(jié)果表明,,這些最初看起來(lái)非常不尋常的插入事件,,實(shí)際上可以自然地發(fā)生在動(dòng)物的beta冠狀病毒中。"
"我們的工作進(jìn)一步揭示了SARS-CoV-2的進(jìn)化祖先,,"他補(bǔ)充說(shuō),。"無(wú)論是RaTG13還是RmYN02都不是SARS-CoV-2的直接祖先,因?yàn)樵谶@些病毒之間仍然存在著進(jìn)化差距,。但我們的研究有力地表明,,對(duì)更多野生物種的采樣將揭示與SARS-CoV-2甚至其直系祖先關(guān)系更密切的病毒,這將告訴我們關(guān)于這種病毒如何在人類(lèi)中出現(xiàn)的大量信息,。"(生物谷Bioon.com)
參考資料:
A close relative of SARS-CoV-2 found in bats offers more evidence it evolved naturally
Hong Zhou et al,, A novel bat coronavirus closely related to SARS-CoV-2 contains natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the spike protein, Current Biology (2020). DOI: 10.1016/j.cub.2020.05.023(潤(rùn)寶醫(yī)療網(wǎng))