分光光度計(jì)已經(jīng)成為現(xiàn)代分子生物實(shí)驗(yàn)室常規(guī)儀器,。常用于核酸,蛋白定量以及細(xì)菌生長(zhǎng)濃度的定量,。
分光光度計(jì)采用一個(gè)可以產(chǎn)生多個(gè)波長(zhǎng)的光源,,通過(guò)系列分光裝置,從而產(chǎn)生特定波長(zhǎng)的光源,,光源透過(guò)測(cè)試的樣品后,,部分光源被吸收,計(jì)算樣品的吸光值,,從而轉(zhuǎn)化成樣品的濃度,。樣品的吸光值與樣品的濃度成正比。
核酸的定量
核酸的定量是分光光度計(jì)使用頻率最高的功能,??梢远咳苡诰彌_液的寡核苷酸,單鏈,、雙鏈DNA,,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波長(zhǎng)260nm,。每種核酸的分子構(gòu)成不一,,因此其換算系數(shù)不同。定量不同類(lèi)型的核酸,,事先要選擇對(duì)應(yīng)的系數(shù),。如:1OD的吸光值分別相當(dāng)于50μg/ml的dsDNA,37μg/ml的ssDNA,,40μg/ml的RNA,,30μg/ml的Olig。測(cè)試后的吸光值經(jīng)過(guò)上述系數(shù)的換算,從而得出相應(yīng)的樣品濃度,。測(cè)試前,,選擇正確的程序,輸入原液和稀釋液的體積,,爾后測(cè)試空白液和樣品液,。然而,實(shí)驗(yàn)并非一帆風(fēng)順,。讀數(shù)不穩(wěn)定可能是實(shí)驗(yàn)者最頭痛的問(wèn)題,。靈敏度越高的儀器,表現(xiàn)出的吸光值漂移越大,。
事實(shí)上,,分光光度計(jì)的設(shè)計(jì)原理和工作原理,允許吸光值在一定范圍內(nèi)變化,,即儀器有一定的準(zhǔn)確度和精確度,。如Eppendorf Biophotometer的準(zhǔn)確度≤1.0%(1A)。這樣多次測(cè)試的結(jié)果在均值1.0%左右之間變動(dòng),,都是正常的,。另外,還需考慮核酸本身物化性質(zhì)和溶解核酸的緩沖液的pH值,,離子濃度等:在測(cè)試時(shí),,離子濃度太高,也會(huì)導(dǎo)致讀數(shù)漂移,,因此建議使用pH值一定,、離子濃度較低的緩沖液,如TE,,可大大穩(wěn)定讀數(shù),。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由于樣品中不可避免存在一些細(xì)小的顆粒,尤其是核酸樣品,。這些小顆粒的存在干擾測(cè)試效果,。為了最大程度減少顆粒對(duì)測(cè)試結(jié)果的影響,要求核酸吸光值至少大于0.1A,,吸光值最好在0.1-1.5A,。在此范圍內(nèi),顆粒的干擾相對(duì)較小,,結(jié)果穩(wěn)定。從而意味著樣品的濃度不能過(guò)低,,或者過(guò)高(超過(guò)光度計(jì)的測(cè)試范圍),。最后是操作因素,如混合要充分,否則吸光值太低,,甚至出現(xiàn)負(fù)值,;混合液不能存在氣泡,空白液無(wú)懸浮物,,否則讀數(shù)漂移劇烈,;必須使用相同的比色杯測(cè)試空白液和樣品,否則濃度差異太大,;換算系數(shù)和樣品濃度單位選擇一致,;不能采用窗口磨損的比色杯;樣品的體積必須達(dá)到比色杯要求的最小體積等多個(gè)操作事項(xiàng),。
除了核酸濃度,,分光光度計(jì)同時(shí)顯示幾個(gè)非常重要的比值表示樣品的純度,如A260/A280的比值,,用于評(píng)估樣品的純度,,因?yàn)榈鞍椎奈辗迨?80nm。純凈的樣品,,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA),。如果比值低于1.8或者2.0,表示存在蛋白質(zhì)或者酚類(lèi)物質(zhì)的影響,。A230表示樣品中存在一些污染物,,如碳水化合物,多肽,,苯酚等,,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0。A320檢測(cè)溶液的混濁度和其他干擾因子,。純樣品,,A320一般是0。
蛋白質(zhì)的直接定量(UV法)
這種方法是在280nm波長(zhǎng),,直接測(cè)試蛋白,。選擇Warburg公式,光度計(jì)可以直接顯示出樣品的濃度,,或者是選擇相應(yīng)的換算方法,,將吸光值轉(zhuǎn)換為樣品濃度。蛋白質(zhì)測(cè)定過(guò)程非常簡(jiǎn)單,,先測(cè)試空白液,,然后直接測(cè)試蛋白質(zhì)。由于緩沖液中存在一些雜質(zhì),,一般要消除320nm的“背景”信息,,設(shè)定此功能“開(kāi)”,。與測(cè)試核酸類(lèi)似,要求A280的吸光值至少大于0.1A,,最佳的線(xiàn)性范圍在1.0-1.5之間,。實(shí)驗(yàn)中選擇Warburg公式顯示樣品濃度時(shí),發(fā)現(xiàn)讀數(shù)“漂移”,。這是一個(gè)正常的現(xiàn)象,。事實(shí)上,只要觀察A280的吸光值的變化范圍不超過(guò)1%,,表明結(jié)果非常穩(wěn)定,。漂移的原因是因?yàn)閃arburg公式吸光值換算成濃度,乘以一定的系數(shù),,只要吸光值有少許改變,,濃度就會(huì)被放大,從而顯得結(jié)果很不穩(wěn)定,。蛋白質(zhì)直接定量方法,,適合測(cè)試較純凈、成分相對(duì)單一的蛋白質(zhì),。紫外直接定量法相對(duì)于比色法來(lái)說(shuō),,速度快,操作簡(jiǎn)單,;但是容易受到平行物質(zhì)的干擾,,如DNA的干擾;另外敏感度低,,要求蛋白的濃度較高,。
比色法蛋白質(zhì)定量
蛋白質(zhì)通常是多種蛋白質(zhì)的化合物,比色法測(cè)定的基礎(chǔ)是蛋白質(zhì)構(gòu)成成分:氨基酸(如酪氨酸,,絲氨酸)與外加的顯色基團(tuán)或者染料反應(yīng),,產(chǎn)生有色物質(zhì)。有色物質(zhì)的濃度與蛋白質(zhì)反應(yīng)的氨基酸數(shù)目直接相關(guān),,從而反應(yīng)蛋白質(zhì)濃度,。
比色方法一般有BCA,Bradford,,Lowry 等幾種方法,。
Lowry 法:以最早期的Biuret反應(yīng)為基礎(chǔ),并有所改進(jìn),。蛋白質(zhì)與Cu2+反應(yīng),,產(chǎn)生藍(lán)色的反應(yīng)物。但是與Biuret 相比,,Lowry法敏感性更高,。缺點(diǎn)是需要順序加入幾種不同的反應(yīng)試劑,;反應(yīng)需要的時(shí)間較長(zhǎng);容易受到非蛋白物質(zhì)的影響,;含EDTA,Tritonx-100,,ammonia sulfate 等物質(zhì)的蛋白不適合此種方法,。
BCA(Bicinchoninine acid assay)法:這是一種較新的、更敏感的蛋白測(cè)試法,。要分析的蛋白在堿性溶液里與Cu2+反應(yīng)產(chǎn)生Cu+,,后者與BCA形成螯合物,形成紫色化合物,,吸收峰在562nm波長(zhǎng),。此化合物與蛋白濃度的線(xiàn)性關(guān)系極強(qiáng),反應(yīng)后形成的化合物非常穩(wěn)定,。相對(duì)于Lowry法,,操作簡(jiǎn)單,敏感度高,。但是與Lowry法相似的是容易受到蛋白質(zhì)之間以及去污劑的干擾,。
Bradford法:這種方法的原理是蛋白質(zhì)與考馬斯亮蘭結(jié)合反應(yīng),產(chǎn)生的有色化合物吸收峰595nm,。其最大的特點(diǎn)是,,敏感度好,是Lowry和BCA 兩種測(cè)試方法的2倍,;操作更簡(jiǎn)單,,速度更快;只需要一種反應(yīng)試劑,;化合物可以穩(wěn)定1小時(shí),,方便結(jié)果;而且與一系列干擾Lowry,,BCA反應(yīng)的還原劑(如DTT,,巰基乙醇)相容。但是對(duì)于去污劑依然是敏感的,。最主要的缺點(diǎn)是不同的標(biāo)準(zhǔn)品會(huì)導(dǎo)致同一樣品的結(jié)果差異較大,,無(wú)可比性。
某些初次接觸比色法測(cè)定的研究者可能為各種比色法測(cè)出的結(jié)果并不一致,,感到迷惑,,究竟該相信哪種方法?由于各種方法反應(yīng)的基團(tuán)以及顯色基團(tuán)不一,,所以同時(shí)使用幾種方法對(duì)同一樣品得出的樣品濃度無(wú)可比性,。例如:Keller等測(cè)試人奶中的蛋白,,結(jié)果Lowry,BCA測(cè)出的濃度明顯高于Bradford,,差異顯著,。即使是測(cè)定同一樣品,同一種比色法選擇的標(biāo)準(zhǔn)樣品不一致,,測(cè)試后的濃度也不一致,。如用Lowry測(cè)試細(xì)胞勻漿中的蛋白質(zhì),以BSA作標(biāo)準(zhǔn)品,,濃度1.34mg/ml,,以a球蛋白作標(biāo)準(zhǔn)品,濃度2.64mg/ml,。因此,,在選擇比色法之前,最好是參照要測(cè)試的樣本的化學(xué)構(gòu)成,,尋找化學(xué)構(gòu)成類(lèi)似的標(biāo)準(zhǔn)蛋白作標(biāo)準(zhǔn)品,。另外,比色法定量蛋白質(zhì),,經(jīng)常出現(xiàn)的問(wèn)題是樣品的吸光值太低,,導(dǎo)致測(cè)出的樣品濃度與實(shí)際的濃度差距較大,。關(guān)鍵問(wèn)題是,,反應(yīng)后1011分光光度計(jì)的重要配件——比色杯的顏色是有一定的半衰期,所以每種比色法都列出了反應(yīng)測(cè)試時(shí)間,,所有的樣品(包括標(biāo)準(zhǔn)樣品),,都必須在此時(shí)間內(nèi)測(cè)試。時(shí)間過(guò)長(zhǎng),,得到的吸光值變小,,換算的濃度值降低。除此,,反應(yīng)溫度,、溶液PH值等都是影響實(shí)驗(yàn)的重要原因。此外,,非常重要的是,,最好是用塑料的比色法。避免使用石英或者玻璃材質(zhì)的比色杯,,因?yàn)榉磻?yīng)后的顏色會(huì)讓石英或者玻璃著色,,導(dǎo)致樣品吸光值不準(zhǔn)確。
細(xì)菌細(xì)胞密度(OD 600)
實(shí)驗(yàn)室確定細(xì)菌生長(zhǎng)密度和生長(zhǎng)期,,多根據(jù)經(jīng)驗(yàn)和目測(cè)推斷細(xì)菌的生長(zhǎng)密度,。在遇到要求較高的實(shí)驗(yàn),,需要采用分光光度計(jì)準(zhǔn)確測(cè)定細(xì)菌細(xì)胞密度。OD600是追蹤液體培養(yǎng)物中微生物生長(zhǎng)的標(biāo)準(zhǔn)方法,。以未加菌液的培養(yǎng)液作為空白液,,之后定量培養(yǎng)后的含菌培養(yǎng)液,。為了保證正確操作,,必須針對(duì)每種微生物和每臺(tái)儀器用顯微鏡進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù),做出校正曲線(xiàn),。實(shí)驗(yàn)中偶爾會(huì)出現(xiàn)菌液的OD值出現(xiàn)負(fù)值,原因是采用了顯色的培養(yǎng)基,,即細(xì)菌培養(yǎng)一段時(shí)間后,與培養(yǎng)基反應(yīng),,發(fā)生變色反應(yīng)。另外,,需要注意的是,測(cè)試的樣品不能離心,,保持細(xì)菌懸浮狀態(tài),。
分光光度計(jì)的重要配件—— 比色杯
比色杯按照材質(zhì)大致分為石英杯,、玻璃杯以及塑料杯,。根據(jù)不同的測(cè)量體積,有比色杯和毛細(xì)比色杯等,。一般測(cè)試核酸和紫外定量蛋白,,均采用石英杯或者玻璃杯,但是不適合比色法測(cè)定,。因?yàn)榉磻?yīng)中的染料(如考馬斯亮蘭)能讓石英和玻璃著色,,所以必須采用一次性的塑料杯。而塑料杯一般不適合用于在紫外范圍內(nèi)測(cè)試樣品,。
由于另外測(cè)試的樣品量不同,,所以一般分光光度計(jì)廠家提供不同容積的比色杯以滿(mǎn)足用戶(hù)不同的需求。目前市場(chǎng)已經(jīng)存在一種既可用于核酸,、紫外蛋白質(zhì)定量,,亦可用于蛋白比色法測(cè)定的塑料杯,樣品用量?jī)H需50μl,,比色杯單個(gè)無(wú)菌包裝,,可以回收樣品。如EppendorfUVette®塑料比色杯,,是目前比色杯市場(chǎng)上一個(gè)革新,。隨著生命科學(xué)以及相關(guān)學(xué)科發(fā)展,對(duì)此類(lèi)科學(xué)的實(shí)驗(yàn)研究提出更高的要求,,分光光度計(jì)將是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室不可缺少的儀器,,也成為微生物、食品,、制藥等相關(guān)實(shí)驗(yàn)室的必備設(shè)備之一,。
分光光度技術(shù)
6.1 基本原理
利用紫外光、可見(jiàn)光,、紅外光和激光等測(cè)定物質(zhì)的吸收光譜,,利用此吸收光譜對(duì)物質(zhì)進(jìn)行定性定量分析和物質(zhì)結(jié)構(gòu)分析的方法,稱(chēng)為分光光度法或分光光度技術(shù),,使用的儀器稱(chēng)為分光光度計(jì),,這種分光光度計(jì)靈敏度高,測(cè)定速度快,,應(yīng)用范圍廣,,其中的紫外/可見(jiàn)分光光度技術(shù)更是生物化學(xué)研究工作中必不可少的基本手段之一。因此本章重點(diǎn)討論紫外/可見(jiàn)分光光度法的基本原理,、儀器構(gòu)造及其在生化領(lǐng)域中的應(yīng)用等,。
1. 光譜:
光是電磁波,可用波長(zhǎng)“λ”表示,,電磁波譜是由不同性質(zhì)的連續(xù)波長(zhǎng)的光譜所組成,,對(duì)于生物化學(xué)來(lái)說(shuō),最重要的波長(zhǎng)區(qū)域是可見(jiàn)光和紫外光,。
光的波長(zhǎng)是二個(gè)相鄰的波峰之間的距離,。
光的傳播是由相互垂直的電場(chǎng)分量“E”和磁場(chǎng)分量“H”所構(gòu)成。
λ=C/ν
λ——波長(zhǎng) C——光速 ν——頻率,,單位時(shí)間通過(guò)一個(gè)定點(diǎn)的波數(shù),。
光又可以看作是由具有能量的粒子所組成。這些粒子所具有的原能量“E”由下式算出:
E=h•ν
H——普朗克常數(shù)( 6.624×10-27爾格•秒)
ν——頻率
紫外區(qū)可分為紫外(近紫外)和真空紫外(遠(yuǎn)紫外),。由于吸收池(又稱(chēng)樣品池,、比色杯等)和光學(xué)元件以及氧氣能吸收小于190nm波長(zhǎng)的光,因此常規(guī)紫外測(cè)定集中在近紫外區(qū),,即200nm~400nm,。可見(jiàn)光區(qū)為400nm~800nm。
組成物質(zhì)的分子均處于一定能態(tài)并不停地運(yùn)動(dòng)著,,分子的運(yùn)動(dòng)可分為平動(dòng),、轉(zhuǎn)動(dòng)、振動(dòng)和分子內(nèi)電子的運(yùn)動(dòng),,每種運(yùn)動(dòng)狀態(tài)都處于一定的能級(jí),,因此分子的能量可以寫(xiě)成:
E=E0+E平+E轉(zhuǎn)+E振+E電
E0是分子內(nèi)在的不隨分子運(yùn)動(dòng)而改變的能量,平動(dòng)能E平只是溫度的函數(shù),,因此與光譜有關(guān)的能量變化是分子的轉(zhuǎn)動(dòng)能量,、振動(dòng)能量和分子的電子能量。
分子的每一種能量都有一系列的能級(jí),,能級(jí)不是任意的,,而是具有量子化特征的,通常分子處于基態(tài),,當(dāng)它吸收一定能量躍遷到激發(fā)態(tài),,則產(chǎn)生吸收光譜。分子轉(zhuǎn)動(dòng),、振動(dòng)和電子能級(jí)的躍遷,相應(yīng)地產(chǎn)生轉(zhuǎn)動(dòng),、振動(dòng)及電子光譜,。
按照量子力學(xué)原理,分子能態(tài)按一定的規(guī)律跳躍式地變化,,物質(zhì)在入射光的照射下,,分子吸收光時(shí),其能量的增加是不連續(xù)的,,物質(zhì)只能吸收一定能量的光,,吸收光的頻率和兩個(gè)能級(jí)間的能量差要符合下列關(guān)系:
E=E2- E1=h
E1、E2分別表示初能態(tài)和終能態(tài)的能量,,初能態(tài)與終能態(tài)之間的能量差愈大,,則所吸收的光的頻率愈高(即波長(zhǎng)愈短),反之則所吸收的光的頻率愈低(即波長(zhǎng)愈長(zhǎng)),。由于吸收是不連續(xù)的,,因此在光的一定部位出現(xiàn)一系列吸收暗帶。因?yàn)榉肿愚D(zhuǎn)動(dòng),、振動(dòng)及電子能級(jí)躍遷的能量差別較大,,因此,它們的吸收光譜出現(xiàn)在不同的光譜區(qū)域,。分子轉(zhuǎn)動(dòng)能級(jí)級(jí)差小,,△E<0.05電子伏特(ev),分子轉(zhuǎn)動(dòng)光譜的吸收出現(xiàn)在遠(yuǎn)紅外或微波區(qū)。振動(dòng)能級(jí)縱間的差別較大,,
E=0.05~1.0 ev,,振動(dòng)光譜出現(xiàn)在中紅外區(qū)。電子能級(jí)的級(jí)差更大,, E=1~20ev,,所以由電子躍遷得到的光譜出現(xiàn)在可見(jiàn)、紫外或波長(zhǎng)更短的光譜區(qū),。
可見(jiàn)光,、紫外光吸收光譜,是由于分子中聯(lián)系較松散的價(jià)電子被激發(fā)產(chǎn)生躍遷從而吸收光輻射能量形成的,,即分子由基態(tài)變?yōu)榧ぐl(fā)態(tài),,電子由一個(gè)低能級(jí)的軌道(即成鍵軌道),吸收了光能量躍遷到高能級(jí)軌道(稱(chēng)為反鍵軌道),。
與吸收光譜有關(guān)的三種電子是:
⑴ 二個(gè)原子的電子沿其對(duì)稱(chēng)方向相互形成的共價(jià)鍵(即單鍵),,稱(chēng)σ 鍵, 構(gòu)成 鍵的電子稱(chēng)σ電子,,如C-C,、C-H鍵。
⑵ 平行于二個(gè)原子軌道形成的價(jià)鍵(即雙鍵),,稱(chēng)π 鍵,,形成π鍵的電子稱(chēng)為 π電子,如C=C鍵,。
⑶ 未共享成鍵的電子,,稱(chēng)n電子。
各種電子躍遷所需能量大小的順序是:
n→π*<π→π*≤ n→σ*<π→σ*<σ→π*<σ→σ*
紫外吸收光譜主要是由于雙鍵電子,,尤其是共軛雙鍵中的π電子和未共享的電子對(duì)的激發(fā)所產(chǎn)生的,。所以各種物質(zhì)分子對(duì)紫外光的吸光性質(zhì)取決于該分子的雙鍵數(shù)目和未共享電子對(duì)的共軛情況等。
如下表所示:
電子躍遷類(lèi)型與紫外吸收波長(zhǎng)(nm)關(guān)系表
電子躍遷類(lèi)型 例 子 紫外吸收波長(zhǎng)范圍
σ→σ* C-H 100~150 nm
π→π*( 非共軛 ) C=O <200 nm
π→π*( 共軛 ) =C-C= 200~300 nm
n→π* C=O ~300 nm
π→π*躍遷:此類(lèi)躍遷所需能量較小,,吸收波長(zhǎng)在紫外區(qū)的200~300
nm,,不飽和烴、共軛烯烴及芳香烴均可發(fā)生這類(lèi)躍遷,,氨基酸,、蛋白質(zhì)與核酸均含有大量共軛雙鍵,因而200~300
nm的紫外吸收測(cè)定,,在生化實(shí)驗(yàn)技術(shù)中有極廣泛的用途,。
若逐漸改變照射某物質(zhì)的入射光的波長(zhǎng),并測(cè)定物質(zhì)對(duì)各種波長(zhǎng)光的吸收程度(吸光度“A”或光密度“O.D”)或透射程度(透光度“T”),,以波長(zhǎng)λ作橫坐標(biāo),,“A”或“T”為縱座標(biāo),畫(huà)出連續(xù)的“A~λ”或“T~λ”曲線(xiàn),即為該物質(zhì)的吸收光譜曲線(xiàn),。
吸光度 A
D
C
B
λmax λmin 波長(zhǎng)(nm)
由上圖可以看出吸收光譜的特征:
⑴曲線(xiàn)上“A”處稱(chēng)最大吸收峰,,它所對(duì)應(yīng)的波長(zhǎng)稱(chēng)最大吸收波長(zhǎng),以λmax表示,。
⑵曲線(xiàn)上“B”處有一谷,,稱(chēng)最小吸收,它所對(duì)應(yīng)的波長(zhǎng),,所對(duì)應(yīng)的波長(zhǎng),,稱(chēng)最小吸收波長(zhǎng),以λmin 表示,。
⑶曲線(xiàn)上在最大吸收峰旁邊有一小峰“C”,,稱(chēng)肩峰。
⑷在吸收曲線(xiàn)的波長(zhǎng)最短的一端,,曲線(xiàn)上“D”處,,吸收相當(dāng)強(qiáng),但不成峰形,,此處稱(chēng)為末端吸收,。
λmax是化合物中電子能級(jí)躍遷時(shí)吸收的特征波長(zhǎng),不同物質(zhì)有不同的最大吸收峰,,所以它對(duì)鑒定化合物極為重要,。吸收光譜中,λmax,、λmin,、肩峰以及整個(gè)吸收光譜的形狀決定于物質(zhì)的性質(zhì),,其特征隨物質(zhì)的結(jié)構(gòu)而異,,所以是物質(zhì)定性的依據(jù)。
測(cè)定某物質(zhì)的紫外吸收光譜的曲線(xiàn),,可與已知標(biāo)準(zhǔn)的紫外光譜圖相對(duì)照,,對(duì)照時(shí)須注意測(cè)定的條件,如溶劑,、濃度等,。
常用標(biāo)準(zhǔn)的紫處吸收光譜是薩德勒研究實(shí)驗(yàn)公司編制的“Sadtler”紫外標(biāo)準(zhǔn)圖譜集,到七十年代末為止已收集28585個(gè)化合物紫外光譜圖,,此外還有藥物和非極性溶劑紫外光譜圖2000多幅,。
由于化合物紫外吸收峰較少,而且峰形都很寬,,不象紅外光譜是許多指紋峰,,所以在用紫外吸收光譜進(jìn)行化合物定性鑒定時(shí),應(yīng)注意:化合物相同,其紫外光譜應(yīng)完全相同,;但是紫外光譜相同不一定化合物就相同,,可能僅是存在某些相同的發(fā)色團(tuán)或基團(tuán),因此在鑒定時(shí)應(yīng)與紅外光譜相結(jié)合,。
由于電子躍遷的同時(shí)也引起分子的轉(zhuǎn)動(dòng)和振動(dòng)光譜,,要把電子躍遷和分子振動(dòng)、轉(zhuǎn)動(dòng)的躍遷完全分開(kāi)是不可能的,,因此我們常見(jiàn)的紫外吸收光譜是由一個(gè)或幾個(gè)寬的吸收譜帶所組成,。
紫外光譜中常用的術(shù)語(yǔ)有發(fā)色團(tuán)、助色團(tuán),、增色效應(yīng)和減色效應(yīng),。
發(fā)色團(tuán):凡是與飽和碳?xì)浠衔镞B接能引起n→π*、π→π*,、 n→σ*
等電子躍遷的基團(tuán)稱(chēng)為發(fā)色團(tuán),。例如:C=C、C=O等發(fā)色團(tuán),。
助色團(tuán):助色團(tuán)是一些具有非共價(jià)鍵的基團(tuán)(如OH,、NH2、SH等),。這些基團(tuán)在波長(zhǎng)>200nm處沒(méi)有吸收,,當(dāng)它與發(fā)色團(tuán)相連接時(shí),使發(fā)色團(tuán)的吸收帶向長(zhǎng)波移動(dòng),,稱(chēng)為紅移(或淺色效應(yīng)),,紅移的同時(shí)吸收帶的強(qiáng)度增加。若助色團(tuán)與發(fā)色團(tuán)相連接,,產(chǎn)生n→π* 躍遷,,使吸收波長(zhǎng)向短波移動(dòng),稱(chēng)為蘭移(或深色效應(yīng)),。
增色效應(yīng)(hyperchromic effect):
核酸變性或降解,,使得DNA或RNA溶液對(duì)紫外光的吸收明顯增加,即ε值(吸光系數(shù)或稱(chēng)消光系數(shù))顯著升高,,此現(xiàn)象稱(chēng)為增色效應(yīng),。此效應(yīng)是由于堿基之間電子相互作用的改變所致,通常在260nm處測(cè)量,。
減色效應(yīng)(hypochromic effect):
在一定的條件下,,變性的核酸又可以復(fù)性,此時(shí)ε值又明顯減少,,回復(fù)到原來(lái)的核酸分子ε值較低的水平,,即此時(shí)DNA或RNA溶液的紫外光吸收顯著降低,,此現(xiàn)象稱(chēng)為減色效應(yīng),此效應(yīng)也是由于堿基之間電子相互作用的變化所引起的,,通常在260nm條件下測(cè)量,。
2. 光吸收定律:
朗伯——比爾(Lambert-beer)光吸收定律:
A=-lgT=εb c
A——吸光度,,又稱(chēng)光密度“O.D”。
T——透光度,, T=I / I,。,, I,。——為照射到吸收池上的光強(qiáng),,I——為透過(guò)吸收池的光強(qiáng),。
ε——摩爾吸光系數(shù)或克分子吸光系數(shù)(L•mol-1•cm-1),。
b——樣品光程(cm),通常使用1.0cm 的吸收地,,b=1cm,。
C——樣品濃度(mol/L)。
由上式可以看出:吸光度A與物質(zhì)的吸光系數(shù)“ε”和物質(zhì)的濃度“C”成正比。
摩爾吸光系數(shù):是物質(zhì)對(duì)某波長(zhǎng)的光的吸收能力的量度,。ε越大,,吸收光的能力越強(qiáng),,相應(yīng)的分光度法測(cè)定的靈敏度就越高,。ε值越大,,說(shuō)明電子躍遷的幾率大,通常ε=10~105:一般認(rèn)為ε> 104為強(qiáng)吸收,;ε=103~104 為較強(qiáng)吸收,;ε< 102為弱吸收,,此時(shí)分光光度法不靈敏,。因?yàn)橥ǔJ褂梅止夤舛扔?jì)可檢測(cè)出的最小吸光度A=0.001, 所以,,當(dāng)b=1cm,ε=105時(shí),,可檢測(cè)的溶液最小濃度是C=10-8 mol/L,。
常用的吸光系數(shù)還有一種百分吸光系數(shù),即在某一波長(zhǎng)下,,溶液濃度為1%(W /V),液層厚度b=1cm時(shí)的吸光度,,以E1%λmax表示,。
C——百分濃度(W / V)。
L——液層厚度,,吸收杯光徑長(zhǎng)度,。 A——吸光度。
最大吸收波長(zhǎng)λmax時(shí)的ε 和E1%λmax值可用下式換算:
ε=E1%λmax×分子量 / 10
吸光度“A”有一個(gè)重要性質(zhì)是其具有加和性:
A=ε1C1b1+ε2C2b2+ε3C3b3+……=
即混合物的總吸光度等于溶液中的各組份各自在該波長(zhǎng)下吸光度的算術(shù)和,。這是多元混合物分光光度法定量分析的基礎(chǔ),。
若溶液中各溶質(zhì)的吸光系數(shù)ε相同,則各溶質(zhì)吸光度的大小與溶質(zhì)濃度成比例,。例如,,離子交換柱層析分離核苷酸實(shí)驗(yàn)中可利用吸光度計(jì)算回收率:
m=C•V , ∵ ,, ∴
m——溶質(zhì)的量 C——溶質(zhì)濃度
V——溶液體積 A——吸光度
ε——吸光系數(shù) b——吸收池光徑
∴ 回收率 (100%)
(上式中假設(shè)ε總和各核苷酸的ε近似相等)
例一:尿嘧啶核苷酸溶液用1cm石英吸收池測(cè)定
260nm處的吸光度為0.650,,用同一吸收池測(cè)定純?nèi)軇┑奈舛葹?.070,計(jì)算尿嘧啶溶液的摩爾濃度,,已知其摩爾吸光系數(shù)
= 8.2×103 M-1cm-1(M=mol / L)。
∵ A= εbC ∵ A=(溶劑加樣品的吸光度)-(溶劑的吸光度)
∴ A=0.650-0.070=0.580 ∵ b=1cm
∴ C==7.1×10-5 mol / L
例二:1%(W/V,,10 mg /
ml)酪氨酸酶溶液的吸光度為24.9(1cm吸收池,,280nm),計(jì)算A280=0.250的酪氨酸酶溶液的濃度。
由于這兩種酶溶液的百分吸光系數(shù)“E1%1cm,280nm”是相同的,,因此可用正比例法計(jì)算濃度,。
∵ ∴ ∴ C未知=0.01%=0.1mg / ml
6.2 分光光度計(jì)的組成和構(gòu)造:
1.組成:各種型號(hào)的紫外/可見(jiàn)分光度計(jì),不論是何種型式,,基本上都由五部分組成:(1)光源,;(2)單色器(包括產(chǎn)生平行光和把光引向檢測(cè)器的光學(xué)系統(tǒng)),;(3)樣品室;(4)接收檢測(cè)放大系統(tǒng),;(5)顯示或記錄器,。
光 源 單色器 樣品室 檢測(cè)放大系統(tǒng) 顯示器
國(guó)產(chǎn)分光光度計(jì)近年來(lái)已有很大的發(fā)展,,各種檔次的分光光度計(jì)都已更新升級(jí)換代,可見(jiàn)光系列有:721,、722,、723等型號(hào),,紫外/可見(jiàn)光系列有:751,、752,、753,、754,、756等型號(hào),,主要生產(chǎn)廠為上海分析儀器總廠等,。
我系1985年購(gòu)買(mǎi)的瑞士KONTRON康強(qiáng)公司生產(chǎn)的UNICON860型紫/可見(jiàn)光分光光度計(jì),,是雙光束,、快速自動(dòng)掃描、熒屏顯示的高檔分光光度計(jì),。這種雙光束分光光度計(jì)的特點(diǎn)是來(lái)自光源的連續(xù)光譜經(jīng)凹面全息光柵分光后,由出射狹縫得到單色光,,經(jīng)過(guò)由電機(jī)帶動(dòng)的25周/秒左右的旋轉(zhuǎn)鏡分解為“樣品”、“參比”光束,,順序分時(shí)通過(guò)參比池和樣品吸收池,,照射到光電倍增管上,,由于兩條光路是幾乎同時(shí)測(cè)量,,參比信號(hào)又不斷與標(biāo)準(zhǔn)電壓比較,使參比信號(hào)恒定,,所以由光源,、單色器、外界雜光,、光電倍增管以及電源電壓等帶來(lái)的影響,,儀器均能自動(dòng)消除。最快波長(zhǎng)掃描速度為1200nm/min,,有五種測(cè)量功能和五種數(shù)據(jù)處理功能,。
我系2000年購(gòu)買(mǎi)的德國(guó)耶拿(蔡司)公司生產(chǎn)的SPECORD200型高檔紫外/可見(jiàn)光分光光度計(jì)的光路原理圖如下:
SPECORD
200分光光度計(jì)的樣品和參比光路,分別有各自的帶溫控的光電二極管檢測(cè)器,,因而取消了電機(jī)帶動(dòng)的旋轉(zhuǎn)鏡,,大大提高了儀器的穩(wěn)定性及各項(xiàng)檢測(cè)指標(biāo),其波長(zhǎng)范圍是190nm~1100nm,,吸光度測(cè)定范圍是0~3A,,可變狹縫寬度為1nm、2nm和5nm,,儀器使用微機(jī)控制時(shí),,掃描速度最高可達(dá)6000nm/min,寬大的樣品室可以安裝各種附件,,儀器性能優(yōu)良,,適合教學(xué)、科研使用,。該儀器的使用說(shuō)明詳見(jiàn)附錄,。
2. 構(gòu)造:
⑴ 光源:
理想光源的條件是:①能提供連續(xù)的輻射;②光強(qiáng)度足夠大;③在整個(gè)光譜區(qū)內(nèi)光譜強(qiáng)度不隨波長(zhǎng)有明顯變化,;④光譜范圍寬,;⑤使用壽命長(zhǎng),價(jià)格低,。
用于可見(jiàn)光和近紅外光區(qū)的光源是鎢燈,,現(xiàn)在最常用的是鹵鎢燈(Halogenlamp),即石英鎢燈泡中充以鹵素,,以提高鎢燈的壽命,。適用波長(zhǎng)范圍是320~1100nm。由于能量輸出的波動(dòng)為電壓波動(dòng)的四次方倍,,因此電源電壓必須穩(wěn)定,。
用于紫外光區(qū)的是氘燈(Deuteriumlamp),適用波長(zhǎng)范圍是195~400nm,,由于氘燈壽命有限,,國(guó)產(chǎn)氘燈壽命僅五百小時(shí)左右,要注意節(jié)約燈時(shí),。
⑵ 單色器:
單色器是分光光度計(jì)的心臟部分,,它的作用是把來(lái)自光源的混合光分解為單色光并能隨意改變波長(zhǎng)。它的主要組成部件和作用是:
①入射狹縫——限制雜散光進(jìn)入,。
②色散元件——即棱鏡或光柵,,是核心部件,可將混合光分解為單色光,。
③準(zhǔn)直鏡——把來(lái)自入射狹縫的光束轉(zhuǎn)化為平等光,,并把來(lái)自色散元件的平等光聚焦于出射狹縫上。
④出射狹縫——只讓額定波長(zhǎng)的光射出單色器,。
轉(zhuǎn)動(dòng)棱鏡或光柵的波長(zhǎng)盤(pán),,可以改變單色器出射光束的波長(zhǎng);調(diào)節(jié)出入射狹縫隙的寬度,,可以改變出射光束的帶寬和單色光的純度,。
光柵:光柵有透射光柵和反射光柵,實(shí)際應(yīng)用的都是反射光柵,,它又可分為平面反射光柵(即通稱(chēng)的反射光柵或閃爍光柵)和凹面反射光柵兩類(lèi),,凹面反射光柵可以起色散元件和準(zhǔn)直鏡兩個(gè)作用,使色散后的光束聚焦于出射狹縫,,得到銳線(xiàn)光譜,。
光柵的刻制方法有兩種:
機(jī)刻光柵:用金剛刀擠壓鍍于硬質(zhì)玻璃上0.5~1的鋁反射層而得??讨乒ぷ髁繕O大,,一般每分鐘只能刻10條線(xiàn),,刻100mm寬的600線(xiàn)/mm的光柵要100小時(shí)。最多刻到3600線(xiàn)/mm,。由于其制造周期長(zhǎng),,成本高,一般只能制得少量的母光柵,,而實(shí)際應(yīng)用的多是復(fù)制光柵,,即在母光柵上涂上硅油,再鍍上一層鋁,,用環(huán)氧樹(shù)脂粘下來(lái),,就得到復(fù)制光柵。機(jī)刻光柵的缺點(diǎn)是線(xiàn)槽稍有缺陷時(shí)就會(huì)出現(xiàn)“鬼線(xiàn)”,,即位于光譜強(qiáng)線(xiàn)兩側(cè)的模糊不清的假線(xiàn),。
全息光柵:用全息照相法刻制的高精度光柵。即用高強(qiáng)度的相干性極好的單色光,,如激光,,用高分辨的感光材料——光致抗蝕劑記錄干涉條紋,曝光1小時(shí),,化學(xué)處理掉受光部分,,再進(jìn)行真空鍍膜(鍍鋁),,得到全息反射光柵,。這種光柵幾乎沒(méi)有線(xiàn)槽間的周期誤差,幾乎沒(méi)有“鬼線(xiàn)”,,雜散光很少,。最大線(xiàn)槽密度可達(dá)6500線(xiàn)/mm,最大直徑可達(dá)400mm,,刻線(xiàn)越多,,分辨率就越高,最常用的是1200~1500線(xiàn)/mm的全息光柵,。
狹縫,、光譜頻帶寬度和分辨率:
出射狹縫的寬度通常有兩種表示方法:一為狹縫的實(shí)際寬度,以毫米(mm)表示,,另一種為光譜頻帶寬度,,即指由出射狹縫射出光束的光譜寬度,以毫微米nm表示,。例如,,出射狹縫的寬度是6nm,并不是說(shuō)出射狹縫的寬度是6nm,,而是指由此狹縫射出的光具有6nm的光譜帶寬,。
純粹的單色光只是一種理想情況,,分光光度計(jì)所能得到的“單色光”,實(shí)際上只是具有一定波長(zhǎng)范圍的譜帶,,狹縫越寬,,所包括的波長(zhǎng)范圍也愈寬。
對(duì)單色光純度來(lái)說(shuō),,狹縫是愈窄愈好,,但光的強(qiáng)度也就越弱,因此狹縫不能無(wú)限制地小,,狹縫的最小寬度取決于檢測(cè)器能準(zhǔn)確地進(jìn)行測(cè)量的最小光能量,。目前達(dá)到的最小寬度為0.1nm。
光譜有效頻帶寬度“b’”——是檢測(cè)器檢測(cè)到的光能量為峰值一半處的二點(diǎn)間的波長(zhǎng)間隔,,如下圖所示:
光強(qiáng)度 P
b’ ——光譜有效頻帶寬(nm)
b ——狹縫寬度(mm) 1/2h
——線(xiàn)色散率 b’ 光譜有效頻帶寬b’
dλ——波長(zhǎng)差 1/2h
dS——出射狹縫平面上二條 波長(zhǎng)λ
光線(xiàn)(dλ)所分開(kāi)的距離(mm)
由上式可以看出,,b’與b成正比, 與線(xiàn)色散率成反比,。線(xiàn)色散率越大,,則可得到的有效頻帶寬度越小。
分辨率:是儀器對(duì)相鄰的兩個(gè)峰可分辨的最小波長(zhǎng)間隔,,是儀器分辨鄰近二條譜線(xiàn)的能力,。
例如若可分開(kāi)鈉雙線(xiàn):則高的分辨率可達(dá):R=105。所以,,狹縫寬度b越小,,光譜帶寬b’越小,分辨率就越高,。
何種情況算是能夠分辨:定義為二條譜線(xiàn)的峰與谷處于同一位置時(shí),,此二個(gè)峰認(rèn)為是剛好能分辨。
由于光柵分光其色散是線(xiàn)性的,,所以只用一種狹縫寬度對(duì)各種波長(zhǎng)的光的測(cè)量,,其分辨率都相同,即狹縫寬度不必經(jīng)常調(diào)節(jié),。只要光強(qiáng)能達(dá)到要求,,應(yīng)使用盡可能小的狹縫寬度,以提高分辨率,。
⑶樣品室:包括有池架,、吸收池(即比色杯)、以及各種可更換的附件,。池架有普通池架和恒溫池架,,恒溫池架有水恒溫池架和電恒溫池架。水恒溫池架需用循環(huán)水恒溫裝置打入循環(huán)水保持池架恒溫,,控溫精度為0.1℃,,電恒溫池架十分昂貴,,控溫精度可達(dá) 0.05℃。
吸收池有光學(xué)玻璃杯和石英玻璃杯兩種,。光學(xué)玻璃杯因?yàn)槠胀ü鈱W(xué)玻璃吸收紫外光,,因此只能用于可見(jiàn)光,適用波長(zhǎng)范圍是400nm~2000nm,。石英玻璃杯可透過(guò)紫外光,、可見(jiàn)光和紅外光,是最常使用的吸收池,,使用波長(zhǎng)范圍是180nm~3000nm,。
吸收池的形狀有長(zhǎng)方形,方形和園筒形,,光程可由0.1cm至10cm,,最常用的是1cm池(容積3ml),光程要求極精確,,透光的玻璃面要嚴(yán)格垂直于光路,,有的石英杯上方刻有箭頭“→”,標(biāo)明杯子使用時(shí)的透光方向,,反方向使用會(huì)有偏差,。
有各種用途的石英吸收池:如液體池、氣體池,、微量池(容積5μl~1ml),、流動(dòng)池(測(cè)量連續(xù)流動(dòng)的樣品)、長(zhǎng)光徑池(測(cè)量稀溶液用),、可裝拆池(便于清洗)等,。
石英杯通常還配有玻璃或塑料蓋,用以防止樣品揮發(fā)和氧化,,以及杯內(nèi)樣品的快速混合。
吸收池使用注意事項(xiàng):
① 要徹底清洗,,尤其是盛過(guò)蛋白質(zhì)等溶液,,干后形成一層膜,不易洗去,,通常杯子不用時(shí)可放在
1%洗潔凈液中浸泡,,去污效果好,使用時(shí)用水沖洗干凈,,要求杯壁不掛水珠,,還可以用綢布絲線(xiàn)或軟塑料制作一個(gè)小刷子清洗杯子。
② 嚴(yán)禁用手指觸摸透光面,,因指紋不易洗凈,。嚴(yán)禁用硬紙和布擦拭透光面,,只能使用鏡頭紙和綢布。
③ 嚴(yán)禁加熱烘烤,。急用干的杯子時(shí),,可用酒精蕩洗后用冷風(fēng)吹干。決不可用超聲波清洗器清洗,。
④吸收池的校正:要固定參比杯和樣品杯,,可在杯的毛玻璃面上寫(xiě)上記號(hào)。用盛有參比液的參比杯和樣品杯測(cè)定吸光度“A0”,,樣品杯換上樣品液后測(cè)定的吸光度為“A1”,,則校正后的實(shí)際吸光度A為:A= A1-A0高檔的分光光度計(jì)有自動(dòng)置零系統(tǒng),可將二個(gè)杯子的偏差置零,。
其他重要附件:高檔分光光度計(jì)的樣品室還可以更換各種重要附件,,用于各種特殊量測(cè)。如換上“積分球”,,可用來(lái)檢測(cè)微弱透光和不透光的樣品,。換上“凝膠掃描裝置”,可用于電泳凝膠膠條上樣品帶的掃描測(cè)量,。
⑷ 檢測(cè)器:檢測(cè)器是一種光電轉(zhuǎn)換設(shè)備,,即把光強(qiáng)度以電訊號(hào)顯示出來(lái),常用的檢測(cè)器有光電管,,光電倍增管和光電二極管等三種,。
①光電管:光電管可檢測(cè)10微微安(10-11A)的光電流,管內(nèi)抽真空充入惰性氣體,,常用國(guó)產(chǎn)真空光電管有GD-5蘭敏光電管(適用波長(zhǎng)為210~625nm),;GD-6紅敏光電管(適用波長(zhǎng)為625~1000nm)。751型分光光度計(jì)即使用這兩只光電管,。
②光電倍增管:它是檢測(cè)弱光的最靈敏最常用的光電元件,,其靈敏度比光電管高200多倍,光電子由陰極到陽(yáng)極重復(fù)發(fā)射9次以上,,每一個(gè)光電子最后可產(chǎn)生106~107個(gè)電子,,因此總放大倍數(shù)可達(dá)106~107倍,光電倍增管的響應(yīng)時(shí)間極短,,能檢測(cè)10-8~10-9秒級(jí)的脈沖光,。其靈敏度與光電管一樣受到暗電流的限制,暗電流主要來(lái)自陰極發(fā)射的熱電子和電極間的漏電,。
③光電二極管:其原理是這種硅二極管受紫外~近紅外輻射照射時(shí),,其導(dǎo)電性增強(qiáng)的大小與光強(qiáng)或正比。近年來(lái)分光光度計(jì)使用光電二極管作檢測(cè)器在增加,雖然其靈敏度還趕不上光電倍增管,,但它的穩(wěn)定性更好,,使用壽命更長(zhǎng),價(jià)格便宜,,因而許多著名品牌的高檔分光光度計(jì)都在使用它作檢測(cè)器,。尤其值得注意的是由于計(jì)算機(jī)技術(shù)的飛速發(fā)展,使用光電二極管的二極管陣列分光光度計(jì)有了很大的發(fā)展,,二極管數(shù)目已達(dá)1024個(gè),,大大提高了分辨率。這種新型分光光度計(jì)的特點(diǎn)是“后分光”,,即氘燈發(fā)射的光經(jīng)透鏡聚焦后穿過(guò)樣品吸收池,,經(jīng)全息光柵色散后被二極管陣列的各個(gè)二極管接收,信號(hào)由計(jì)算機(jī)進(jìn)行處理和存儲(chǔ),,因而掃描速度極快,,約10ms就可完成全波段掃描,繪出吸光度,、波長(zhǎng)和時(shí)間的三維立體色譜圖,,可以最方便快速地得到任一波長(zhǎng)的吸收數(shù)據(jù),它最適宜用于動(dòng)力學(xué)測(cè)定,,也是高效液相色譜儀最理想的檢測(cè)器,。
⑸ 顯示裝置:低檔分光光度計(jì)現(xiàn)在已都使用數(shù)字顯示,有的還連有打印機(jī)?,F(xiàn)代高性能分光光度計(jì)均可以連接微機(jī),,而且有的主機(jī)還使用帶液晶或CRT熒屏顯示的微處理機(jī)和打印繪圖機(jī),有的還帶有標(biāo)準(zhǔn)軟驅(qū),,存取數(shù)據(jù)更加方便(例如SPECORD200),。
6.3 分光光度法在生化實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的應(yīng)用:
分光光度計(jì)除用于常規(guī)的吸光度測(cè)定和吸收光譜的掃描外,常用的分光光度法還有導(dǎo)數(shù)分光光度法,、催化動(dòng)力學(xué)分光光度法和差示分光光度法等,。
在生化實(shí)驗(yàn)中主要用于氨基酸含量的測(cè)定、蛋白質(zhì)含量的測(cè)定,、核酸的測(cè)定,、酶活力測(cè)定、生物大分子的鑒定和酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)的研究等,。
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