本報(bào)訊 （記者徐 婧）近日，在國際合成生物學(xué)領(lǐng)域權(quán)威刊物美國化學(xué)學(xué)會(huì)合成生物學(xué)雜志（ACS Synthetic Biology,，影響因子：5.316）上,，清華大學(xué)教授李梢課題組《基于網(wǎng)絡(luò)CRISPR-Cas9組合識別人體細(xì)胞中的協(xié)同機(jī)制》一文被作為封面文章發(fā)表。

　　課題組研究發(fā)現(xiàn),，中醫(yī)經(jīng)典名方六味地黃丸及其類方中,，能識別出若干可以抑制腸炎細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的中藥成分。

　　課題組針對我國消化道惡性腫瘤發(fā)病率逐年升高的趨勢,，試圖從生物分子網(wǎng)絡(luò)角度來認(rèn)識炎癌轉(zhuǎn)化和腫瘤發(fā)生的內(nèi)在機(jī)理,，有助于克服以往單靶標(biāo)研究模式的局限，從系統(tǒng)的角度進(jìn)行腫瘤的精準(zhǔn)預(yù)防,，促進(jìn)腫瘤“治未病”研究的進(jìn)展,。

　　課題組提出了一個(gè)結(jié)合計(jì)算預(yù)測和實(shí)驗(yàn)分析為一體的方法,，這一方法可以發(fā)現(xiàn)消化系統(tǒng)炎癌轉(zhuǎn)化過程是如何發(fā)生和進(jìn)展的,。

　　隨后課題組利用CIPHER（一種自主研制的、基于網(wǎng)絡(luò)的全基因組致病基因預(yù)測方法）進(jìn)行炎,、癌相關(guān)基因預(yù)測,，結(jié)合臨床上消化系統(tǒng)不同部位（胃、腸和肝）,、不同階段（正常人,、炎癥和癌癥患者）的公共基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，篩選出了哪些基因可能會(huì)影響消化系統(tǒng)的炎癌轉(zhuǎn)化進(jìn)程,，也即與消化系統(tǒng)炎癌轉(zhuǎn)化顯著相關(guān)的候選基因集,，構(gòu)建出影響炎癌轉(zhuǎn)化的關(guān)鍵因子網(wǎng)絡(luò)。

　　接著,，課題組使用轉(zhuǎn)化生長因子（TGFβ1）誘導(dǎo)腸上皮細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化,，并用新的CRISPR-Cas9組合（一種基因治療法，這種方法能夠通過DNA剪切技術(shù)治療多種疾?。┻M(jìn)行篩選,，識別炎癌轉(zhuǎn)化關(guān)鍵子網(wǎng)中的差異遺傳相互作用網(wǎng)絡(luò)模塊。通過對炎癥誘導(dǎo)的差異遺傳相互作用網(wǎng)絡(luò)模塊分析，揭示了顯著差異的基因之間的功能協(xié)同特征,。

　　最后,，課題組以炎癌轉(zhuǎn)化關(guān)鍵子網(wǎng)中的協(xié)同功能模塊為干預(yù)靶標(biāo)，從前期發(fā)現(xiàn)的具有抑制炎癌轉(zhuǎn)化潛在功效的中醫(yī)經(jīng)典名方六味地黃丸及其類方中,，識別出若干能夠不同程度地干預(yù)網(wǎng)絡(luò)中的代謝-免疫等協(xié)同作用模塊,、抑制腸炎細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的中藥成分，為從機(jī)制上揭示中藥的多成分協(xié)同作用提供了新依據(jù),、新途徑,。

　　課題組稱，該研究建立了一條計(jì)算與實(shí)驗(yàn)相結(jié)合的網(wǎng)絡(luò)研究途徑,，用于發(fā)現(xiàn)炎癌轉(zhuǎn)化過程中的調(diào)控機(jī)制,。并預(yù)測了可用于炎癌轉(zhuǎn)化治療的中藥，為深入理解復(fù)雜疾病的發(fā)生過程提供了新的思路,，同時(shí)也為網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法上的新進(jìn)展作出了貢獻(xiàn),。

　　據(jù)悉，早在2014年,，該課題組就采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),、系統(tǒng)生物學(xué)方法，在“寒熱”的生物學(xué)基礎(chǔ)和中藥方劑的研究上取得了新進(jìn)展,。該課題組創(chuàng)建了一套高精度的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)智能算法,，并在炎癌轉(zhuǎn)化、中藥網(wǎng)絡(luò)調(diào)節(jié)機(jī)制等方面取得了系列成果,，為促進(jìn)中藥“古方新用”探索了一條新路,。