來自中國醫(yī)學院/北京協(xié)和醫(yī)學院分子腫瘤學國家重點實驗室,、南京醫(yī)科大學,、中山大學腫瘤防治中心等處的研究人員，通過全基因組關聯(lián)研究技術發(fā)現(xiàn)了三個全新的中國人群食管鱗狀細胞癌（Esophageal squamous cell carcinoma ,，ESCC）易感位點,，這對于解析這一疾病的分子機理,，以及相關治療具有重要意義。這一研究成果公布在《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上,。
領導這一研究的是中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院腫瘤醫(yī)院腫瘤研究所病因及癌變研究室主任林東昕教授,，他曾于1998年獲得國家杰出青年科學基金，2003-2004年度被評為衛(wèi)生部有突出貢獻中青年專家,、國務院頒發(fā)政府特殊津貼專家,。林教授研究組曾較系統(tǒng)地研究了致癌物代謝、DNA修復,、細胞周期和凋亡控制,、腫瘤免疫等系統(tǒng)的基因遺傳變異與肺癌、食管癌,、胃癌,、乳腺癌、結-直腸癌等常見腫瘤發(fā)生和發(fā)展的關系,。
全基因關聯(lián)研究是目前研究常見復雜性疾病易感基因或致病基因最重要和最熱門的方法之一,。在這篇文章中，研究人員運用高密度SNP芯片,，在全基因組范圍檢測了大樣本量的食管癌患者和和正常對照者的基因變異,，并經(jīng)過多中心、大樣本量的病例-對照驗證,，發(fā)現(xiàn)5個染色體區(qū)段的變異（5q11的rs10052657,，21q22的rs2014300，6p21的 rs10484761,，10q23的rs2274223和12q24的rs11066015,、rs2074356和rs11066280）與食管癌發(fā)病相關。其中,，位于染色體12q24的rs11066015,、rs2074356和rs11066280變異與吸煙或/和飲酒有顯著的基因-環(huán)境交互作用。吸煙和飲酒是最明確的與食管癌發(fā)生相關的危險生活方式,。這一研究還顯示,，上述易感位點與食管癌風險有累積關聯(lián)作用，即攜帶危險變異越多,，發(fā)生食管癌的風險越大,。攜帶2至6個風險基因型的人發(fā)生食管癌的風險逐漸由1.27增加到4.60。上述易感位點涉及ALDH2,、RPL6,、PTPN1、C12orf51,、PDE4D,、RUNX1,、UNC5CL和PLCE1等基因，這些基因與乙醛和致癌物代謝,、細胞增殖與凋亡等相關,。該研究成果對深入了解食管癌發(fā)生的分子機理、對食管癌預警,、早期診斷和預防有重要意義,。
這項研究成果是國內(nèi)多家學術單位共同合作的結果，包括林東昕教授課題組,、詹啟敏教授課題組和劉芝華教授課題組等,，吳晨等多名博士研究生參與該研究，為完成該研究做出重要貢獻,。Nature Genetics是具有很高影響力的學術期刊,，2009年影響因子為34.284。（生物谷Bioon.com）
生物谷推薦原文出處：
Nature Genetics DOI:10.1038/ng.849
Genome-wide association study identifies three new susceptibility loci for esophageal squamous-cell carcinoma in Chinese populations
Chen Wu; Zhibin Hu; Zhonghu He; Weihua Jia; Feng Wang; Yifeng Zhou; Zhihua Liu; Qimin Zhan; Yu Liu; Dianke Yu; Kan Zhai; Jiang Chang; Yan Qiao; Guangfu Jin; Zhe Liu; Yuanyuan Shen; Chuanhai Guo; Jianhua Fu; Xiaoping Miao; Wen Tan; Hongbing Shen; Yang Ke; Yixin Zeng; Tangchun Wu; Dongxin Lin
Esophageal squamous-cell carcinoma (ESCC) is one of the most prevalent cancers worldwide and occurs at a relatively high frequency in China. To identify genetic susceptibility loci for ESCC, we conducted a genome-wide association study on 2,031 individuals with ESCC (cases) and 2,044 controls of Chinese descent using 666,141 autosomal SNPs. We evaluated promising associations in an additional 6,276 cases and 6,165 controls of Chinese descent from different areas of China. We identified seven susceptibility loci on chromosomes 5q11, 6p21, 10q23, 12q24 and 21q22 (ranging from P = 7.48 × 10?12 to P = 2.44 × 10?31); among these loci, 5q11, 6p21 and 21q22 were newly identified. Three variants in high linkage disequilibrium on 12q24 confer their risks to ESCC in a gene-lifestyle interaction manner, with more pronounced risk enhancement seen in tobacco and alcohol users. Furthermore, the identified variants had a cumulative association with ESCC risk (Ptrend = 7.92 × 10?56). These findings highlight the involvement of multiple genetic loci and gene-environment interaction in the development of esophageal cancer.
