霸王龍的蛋白似乎能夠保存數(shù)百萬年的時(shí)間 （圖片提供：Photos.com）
科學(xué)家在兩年前報(bào)告說他們?cè)谝痪呔嘟?800萬年的霸王龍化石中發(fā)現(xiàn)了完好無損的蛋白質(zhì)片段，這一研究成果可謂一石激起千層浪,。對(duì)此持懷疑態(tài)度的科學(xué)家認(rèn)為,，其中一條證據(jù)的主線——由質(zhì)譜分析得出的蛋白質(zhì)片段的標(biāo)記——是有缺陷的。然而如今一個(gè)獨(dú)立的研究小組對(duì)相關(guān)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行的再分析支持了最初的結(jié)論,，即恐龍的蛋白質(zhì)真的能夠在時(shí)間的侵襲下保存至今,。
2005年，由美國(guó)羅利市北卡羅來納州立大學(xué)的Mary Schweitzer領(lǐng)導(dǎo)的研究小組在《科學(xué)》雜志上報(bào)告說,，他們發(fā)現(xiàn)了一具不同尋常的霸王龍化石,。這具化石附有一些恐龍的軟組織，其中包括血管和其他纖維組織，并且似乎保存得非常完好,。兩年后,，Schweitzer的研究小組與波士頓市哈佛醫(yī)學(xué)院的質(zhì)譜分析專家John Asara及同事合作，通過質(zhì)譜分析鑒別出7個(gè)縮氨酸片段——這些蛋白質(zhì)片段似乎來自于霸王龍的膠原質(zhì),，并且這些序列接近于雞和其他現(xiàn)代鳥類的相關(guān)序列,，從而被認(rèn)為為鳥類進(jìn)化自恐龍的觀點(diǎn)提供了更多的線索。然而懷疑論者卻認(rèn)為,，這些質(zhì)譜信號(hào)只不過來自于相關(guān)數(shù)據(jù)的背景噪音,。并且他們表示，Schweitzer和Asara無法排除由污染物導(dǎo)致的信號(hào),。
這場(chǎng)爭(zhēng)論一直充斥在隨后的論文和快報(bào)中,。并促使Asara公布了他的全部質(zhì)譜數(shù)據(jù)，從而希望其他專家能夠根據(jù)這些數(shù)據(jù)作出自己的判斷,。最終,，來自美國(guó)加利福尼亞州帕洛阿爾托研究中心和加利福尼亞大學(xué)戴維斯分校的研究人員決定對(duì)此展開研究。他們利用一套完全不同的生物信息學(xué)工具和統(tǒng)計(jì)學(xué)試驗(yàn)對(duì)Asara的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行了再分析,。
加利福尼亞的研究人員報(bào)告說,，其中的3種縮氨酸片段與一種膠原質(zhì)的遠(yuǎn)古形式完全匹配，而其他的匹配則僅有較少的統(tǒng)計(jì)顯著性,。研究人員指出：“總而言之,，我們?cè)诎酝觚埖馁|(zhì)譜中并沒有發(fā)現(xiàn)明顯的錯(cuò)誤：被鑒別出的縮氨酸似乎與包含有可能非常古老的與鳥類似的骨骼的一件標(biāo)本相吻合，這件標(biāo)本僅僅被適量的可以辨明的蛋白質(zhì)所污染,。”研究人員在7月出版的《蛋白質(zhì)組學(xué)研究雜志》（JPR）上報(bào)告了這一研究結(jié)果,。
Asara表示：“這真是一個(gè)非常好的消息。”他推斷新的研究結(jié)果將能夠平息這場(chǎng)爭(zhēng)論,，這是因?yàn)閬碜钥铸埖能浗M織實(shí)在是太罕見的發(fā)現(xiàn),。他說：“我認(rèn)為這項(xiàng)工作為有關(guān)質(zhì)譜分析的解釋畫上了句號(hào)。”如今,，這一來自霸王龍的蛋白質(zhì)已不再是唯一的發(fā)現(xiàn),。今年5月，Schweitzer,、Asara和同事報(bào)告了一個(gè)來自于8000萬年前的恐龍化石的類似研究結(jié)果,，這也為科學(xué)家?guī)砹诵碌南Ｍ?mdash;—他們或許很快就能找到一扇窗口，從而了解恐龍的蛋白質(zhì)分子構(gòu)成,。（生物谷Bioon.com）
生物谷推薦原始出處：
J. Proteome Res., Article ASAP July 15, 2009
Reanalysis of Tyrannosaurus rex Mass Spectra
Marshall Bern*, Brett S. Phinney and David Goldberg
Palo Alto Research Center, 3333 Coyote Hill Road, Palo Alto, California 94304, and Genome Center, University of California at Davis, Davis, California 95616
Asara et al. reported the detection of collagen peptides in a 68-million-year-old Tyrannosaurus rex bone by shotgun proteomics. This finding has been called into question as a possible statistical artifact. We reanalyze Asara et al.’s tandem mass spectra using a different search engine and different statistical tools. Our reanalysis shows a sample containing common laboratory contaminants, soil bacteria, and bird-like hemoglobin and collagen.
