近日,,安徽醫(yī)科大學(xué)、深圳華大基因研究院等單位的研究人員對(duì)21309名中國(guó)銀屑病患者和對(duì)照的目標(biāo)區(qū)域基因測(cè)序研究確認(rèn),,“罕見突變”對(duì)銀屑病的影響可能很有限,。相關(guān)研究成果已在最新一期的《自然—遺傳學(xué)》雜志上發(fā)表。
銀屑病俗稱“牛皮癬”,,是一種常見的慢性炎癥性皮膚病,。此前,主流學(xué)說普遍認(rèn)為,,在人群中頻率較低的罕見突變與復(fù)雜性遺傳疾病的發(fā)生關(guān)系密切,。
科研人員對(duì)781位銀屑病患者以及676位健康對(duì)照者的樣本進(jìn)行了外顯子測(cè)序,希望發(fā)現(xiàn)更多遺傳因素的証據(jù),。他們用數(shù)據(jù)分析的方法,,檢測(cè)到518308個(gè)單核?酸變異(SNVs),,其中,,20.62%的SNVs是非同義突變,68.13%是罕見突變(<1%的等位基因頻率),??紤]到外顯子研究階段樣本量有限,研究者們?cè)诘诙A段又進(jìn)一步對(duì)9946位銀屑病患者和9906位健康對(duì)照者的樣本進(jìn)行了靶向測(cè)序研究,。他們共分析了1326個(gè)靶向基因,,包括622個(gè)與免疫調(diào)節(jié)相關(guān)的基因,發(fā)現(xiàn)了82387個(gè)非同義突變的SNVs,,其中罕見突變所佔(zhàn)比例高達(dá)97.07%,。
經(jīng)進(jìn)一步分析,科研人員在IL23R和GJB2這兩個(gè)基因上檢測(cè)到與全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)信號(hào)獨(dú)立的低頻(1%~5%的等位基因頻率)錯(cuò)義突變關(guān)聯(lián)信號(hào)﹔在LCE3D,、ERAP1,、CARD14 和ZNF816A這幾個(gè)基因中,檢測(cè)到5個(gè)可能是致病突變的常見錯(cuò)義突變與銀屑病的發(fā)生顯著關(guān)聯(lián),。
此外,,研究者們還認(rèn)為,在FUT2 和TARBP1這兩個(gè)基因上發(fā)現(xiàn)的罕見錯(cuò)義突變可能也與銀屑病的發(fā)生有關(guān),,但其關(guān)聯(lián)沒有達(dá)到全基因組顯著水平。在以基因?yàn)閱挝坏臋z驗(yàn)中,,也沒有發(fā)現(xiàn)罕見突變?cè)趯?duì)照和患者中的分布有明顯差異,。此結(jié)果顯示,目標(biāo)區(qū)域編碼區(qū)的低頻和罕見非同義突變對(duì)銀屑病的發(fā)生可能影響有限,。