2012年8月20日 訊 /生物谷BIOON/ --你的DNA不僅是獨特的,，而且它還告訴你所在家族的故事。它通過代代相傳而攜帶你祖先的遺傳歷史,。如今來自以色列特拉維夫大學的Eran Halperin教授和來自美國加州大學洛杉磯分校的研究人員說,，他們也能夠利用它來繪制一個人的家族過去的圖譜。
在這項研究中,，他們正在賦予術語“遺傳圖譜”新的含義,。利用針對地球每個坐標點上的遺傳特征的概率模型，研究人員開發(fā)出一種方法來更加精準地確定一個人祖先起源的地理位置,。
這種新方法能夠精確描述每個人祖先更加具體的位置,，比如將一個人的父系祖先放置在巴黎，將一個人的母系祖先放置在巴塞羅那,。之前的方法采取一種折中的方法,，不準確地將這種起源放置在這兩座城市之間的地點，如里昂,。
相關研究結果刊登在Nature Genetics期刊上,。這種方法有潛力揭示許多不同人群和動物種群的祖先,、起源和遷移模式。它可能也是一種了解基因組的新模型,。
Halperin教授解釋道,，人基因組存在被稱作SNPs的位點，而且這些位點在每個人身上是不同的,。這些位點在過去某個時刻發(fā)生突變,，然后這種突變能夠傳遞到一個特定的地理區(qū)域中大部分人群身上。如今,，一個人擁有這些突變的概率,，依據(jù)他們早期祖先生活的地理位置，而存在不同,。
為了驗證研究人員開發(fā)出的方法,，Halperin教授和他的同事們研究了來自整個歐洲的1157個人的DNA樣品。利用基于基因組突變的概率數(shù)學算法,，他們能夠只根據(jù)DNA數(shù)據(jù)和這種新的數(shù)學模型而準確地確定他們祖先的起源地點,，這些DNA數(shù)據(jù)和數(shù)學模型能夠闡明遺傳信息以便查明一個人父系祖先和母系祖先在圖譜上的兩個不同的位點。研究人員希望拓展這種模型以便鑒定出祖父母,、曾祖父或曾祖母等以此類推的起源,。(生物谷Bioon.com)
本文編譯自A GPS in your DNA: Research says genetics can reveal your geographic ancestral origin
doi: 10.1038/ng.2285
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PMID:
A model-based approach for analysis of spatial structure in genetic data
Wen-Yun Yang, John Novembre, Eleazar Eskin & Eran Halperin
Characterizing genetic diversity within and between populations has broad applications in studies of human disease and evolution. We propose a new approach, spatial ancestry analysis, for the modeling of genotypes in two- or three-dimensional space. In spatial ancestry analysis (SPA), we explicitly model the spatial distribution of each SNP by assigning an allele frequency as a continuous function in geographic space. We show that the explicit modeling of the allele frequency allows individuals to be localized on the map on the basis of their genetic information alone. We apply our SPA method to a European and a worldwide population genetic variation data set and identify SNPs showing large gradients in allele frequency, and we suggest these as candidate regions under selection. These regions include SNPs in the well-characterized LCT region, as well as at loci including FOXP2, OCA2 and LRP1B.
