在為交通運(yùn)輸提供碳中性(平衡)燃料這條漫長且艱難的道路上,美國能源部正尋求多種途徑力圖實(shí)現(xiàn)自己的目標(biāo),。能源部的努力包括探尋自然界中潛在的新型燃料資源,,它們包括從陸地上可作為纖維質(zhì)原料的植物(如快速生長的樹木和多年生牧草)到水中及其他生長環(huán)境中的產(chǎn)油生物(如海藻和細(xì)菌),,極具多樣性。
對(duì)生物燃料研究人員而言,,近期美國《科學(xué)》雜志刊登的一項(xiàng)成果無疑是一條喜訊,。根據(jù)該雜志的報(bào)道,美國能源部聯(lián)合基因組研究所(JGI)和索爾克研究所領(lǐng)導(dǎo)的研究人員破譯了carteri團(tuán)藻(Volvox)的基因組,。carteri團(tuán)藻是一種多細(xì)胞海藻,,它通過光合作用獲取光能。
藻類光合作用藏“玄機(jī)”
據(jù)悉,,美國能源部之所以大力支持光合成生物體內(nèi)復(fù)雜機(jī)制的研究,,為的是更好地認(rèn)識(shí)生物體如何將陽光轉(zhuǎn)換成能量,以及光合成細(xì)胞如何控制生物的新陳代謝過程,。這些信息有助于未來可再生生物燃料的生產(chǎn),。
在《科學(xué)》雜志刊登的文章中,研究人員將團(tuán)藻基因組同其近親單細(xì)胞萊茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)的基因組進(jìn)行了比較,。3年前,,聯(lián)合基因組研究所曾破譯了萊茵衣藻的基因組。衣藻是人們深入研究的潛在的海藻生物燃料資源,。團(tuán)藻和衣藻均屬于團(tuán)藻目家族,,團(tuán)藻基因測(cè)序的重要價(jià)值在于它可以作為衣藻基因參照物(對(duì)比物),研究人員通過數(shù)據(jù)比較來研究它們的光合作用機(jī)理以及多細(xì)胞生物的演化,。
與衣藻不同,,團(tuán)藻包含兩種細(xì)胞:一種是數(shù)量較少的生殖細(xì)胞,另一種則是數(shù)量較多的體細(xì)胞,。生殖細(xì)胞能夠分化形成新的菌落,,與此同時(shí),體細(xì)胞則提供機(jī)動(dòng)力,,并分泌能導(dǎo)致生物體擴(kuò)展的細(xì)胞外基質(zhì),。團(tuán)藻內(nèi)兩種細(xì)胞的分工使得團(tuán)藻比衣藻生長和游動(dòng)都要快,,從而幫助團(tuán)藻能夠躲避捕食者,同時(shí)在更深的水域獲取營養(yǎng),。
文章第一合著者,、索爾克研究所科學(xué)家吉姆·伍曼表示,團(tuán)藻特別令人著迷的地方是它如何有選擇地減少光合作用或調(diào)節(jié)光合作用以支持另一種細(xì)胞,。雖然目前人們還沒有很好地認(rèn)識(shí)團(tuán)藻的這一特性,,但該特性有可能幫助人們通過轉(zhuǎn)基因工程讓光合生物進(jìn)行相應(yīng)變化,生產(chǎn)生物燃料或其他產(chǎn)品,。
并不是“越小越簡(jiǎn)單”
聯(lián)合基因組研究所生物信息學(xué)家西蒙·普魯克尼克解釋說,,研究團(tuán)藻目生物的興趣點(diǎn)在于單細(xì)胞祖先在較短的進(jìn)化時(shí)間段演化成多細(xì)胞和復(fù)雜的細(xì)胞過程。研究人員發(fā)現(xiàn),,盡管團(tuán)藻和衣藻兩種生物的復(fù)雜程度和生命史存在很大差異,,二者的基因組卻有相似的蛋白編碼潛能。與萊茵衣藻相比,,專家在團(tuán)藻細(xì)胞內(nèi)只發(fā)現(xiàn)了很少該生物特有的基因,,也就是說,多細(xì)胞的團(tuán)藻基因組缺乏創(chuàng)新,。因此,,越小越簡(jiǎn)單的理念開始受到挑戰(zhàn),科研人員由此推斷,,從單細(xì)胞生物演變?yōu)槎嗉?xì)胞生物并非必須大幅提高基因的數(shù)目,,在這種演變中,基因如何以及何時(shí)編碼合成特定的蛋白才具有決定意義,。相信隨著更多的單分子生物的基因組被破譯,,人們對(duì)此將會(huì)有更多的了解。
分析顯示,,大約有1800個(gè)蛋白質(zhì)家族屬于團(tuán)藻和衣藻所獨(dú)有,。這些蛋白質(zhì)家族是多細(xì)胞物種生長和發(fā)生形態(tài)變化的基因物質(zhì)資源,尤其是經(jīng)查明,,某些蛋白質(zhì)家族與多細(xì)胞體相關(guān),。團(tuán)藻和衣藻在利用這些蛋白質(zhì)家族方面的不同之處將是人們未來準(zhǔn)備研究的問題。伍曼表示,,團(tuán)藻基因組為衣藻基因組工程以及精確認(rèn)識(shí)形態(tài)進(jìn)化和蛋白質(zhì)創(chuàng)新增加了巨大的價(jià)值,,現(xiàn)在人們需要靜下來研究這些基因的功能。
普魯克尼克認(rèn)為,,團(tuán)藻和衣藻作為易駕馭的實(shí)驗(yàn)?zāi)J缴?,它們的信息可以被人們廣泛使用,包括那些對(duì)團(tuán)藻生物學(xué)不感興趣的研究人員。他表示,,團(tuán)藻基因組是指導(dǎo)其對(duì)目標(biāo)領(lǐng)域進(jìn)行深入研究的極好資源,。
華盛頓大學(xué)名譽(yù)教授大衛(wèi)·科克預(yù)計(jì),由于團(tuán)藻基因組的破譯,,在未來5年里,,研究團(tuán)藻的群體人數(shù)將迅速增加。他說:“認(rèn)識(shí)多細(xì)胞體的起源是我畢生的興趣,,隨著基因組測(cè)序完成,這項(xiàng)工作開始起步了?,F(xiàn)在,,人們可以輕而易舉地獲得更多的答案。真希望自己出生得晚些,,這樣可以成為研究的參與者,。不過,我將在一旁為研究者歡呼,。”(生物谷Bioon.com)