2021年1月28日訊/生物谷BIOON/---加利福尼亞大學(xué)歐文分校領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)新研究發(fā)現(xiàn)了一種識(shí)別生物標(biāo)志物的新方法,，可以幫助早期癌癥診斷,。這項(xiàng)研究的重點(diǎn)是肺癌，但是這種被稱為“細(xì)胞異質(zhì)性調(diào)整的甲基化甲基化（CHALM）”方法也已針對(duì)衰老和阿爾茨海默氏病進(jìn)行了測(cè)試,，有望用于研究其他疾病。
“我們發(fā)現(xiàn)CHALM方法可能是幫助研究人員從基于序列的甲基化數(shù)據(jù)中鑒定出更可靠的差異甲基化基因的有價(jià)值的工具,，”格雷斯·貝爾（Grace B. Bell）主席,，生物信息學(xué)教授Wei Li說,。 “對(duì)于臨床醫(yī)生來說，這種方法可以幫助他們識(shí)別更多有用的生物標(biāo)記物,，從而幫助癌癥診斷,，這是傳統(tǒng)的方法所忽略的?！?br>
(圖片來源：Www.pixabay.com)
該研究發(fā)表在《Nature communications》雜志上,，標(biāo)題為“Cellular Heterogeneity-Adjusted cLonal Methylation (CHALM) improves prediction of gene expression”，研究揭示了從測(cè)序數(shù)據(jù)計(jì)算DNA甲基化水平時(shí)考慮細(xì)胞異質(zhì)性的重要性,。
“將我們的CHALM方法應(yīng)用于肺癌數(shù)據(jù)集之后,，我們能夠鑒定出更可靠的且與生物學(xué)功能相關(guān)的差異甲基化基因。應(yīng)用我們的CHALM方法可能會(huì)導(dǎo)致更好的早期癌癥檢測(cè),，”Li說,。
通過使用傳統(tǒng)的方法識(shí)別癌癥生物標(biāo)記物，基因表達(dá)與啟動(dòng)子甲基化之間的相關(guān)性往往較弱,，尤其是對(duì)于甲基化程度較低的基因而言,。這項(xiàng)新研究發(fā)現(xiàn)CHALM方法可以更可靠地鑒定傳統(tǒng)方法無法檢測(cè)到的甲基化標(biāo)記。（生物谷 Bioon.com）
資訊出處：New study points to better diagnostics for cancer
原始出處：Jianfeng Xu et al, Cellular Heterogeneity–Adjusted cLonal Methylation (CHALM) improves prediction of gene expression, Nature Communications (2021). DOI: 10.1038/s41467-020-20492-7
（潤寶醫(yī)療網(wǎng)）
“我們發(fā)現(xiàn)CHALM方法可能是幫助研究人員從基于序列的甲基化數(shù)據(jù)中鑒定出更可靠的差異甲基化基因的有價(jià)值的工具,，”格雷斯·貝爾（Grace B. Bell）主席,，生物信息學(xué)教授Wei Li說,。 “對(duì)于臨床醫(yī)生來說，這種方法可以幫助他們識(shí)別更多有用的生物標(biāo)記物,，從而幫助癌癥診斷,，這是傳統(tǒng)的方法所忽略的?！?br>
(圖片來源：Www.pixabay.com)該研究發(fā)表在《Nature communications》雜志上,，標(biāo)題為“Cellular Heterogeneity-Adjusted cLonal Methylation (CHALM) improves prediction of gene expression”，研究揭示了從測(cè)序數(shù)據(jù)計(jì)算DNA甲基化水平時(shí)考慮細(xì)胞異質(zhì)性的重要性,。
“將我們的CHALM方法應(yīng)用于肺癌數(shù)據(jù)集之后,，我們能夠鑒定出更可靠的且與生物學(xué)功能相關(guān)的差異甲基化基因。應(yīng)用我們的CHALM方法可能會(huì)導(dǎo)致更好的早期癌癥檢測(cè),，”Li說,。
通過使用傳統(tǒng)的方法識(shí)別癌癥生物標(biāo)記物，基因表達(dá)與啟動(dòng)子甲基化之間的相關(guān)性往往較弱,，尤其是對(duì)于甲基化程度較低的基因而言,。這項(xiàng)新研究發(fā)現(xiàn)CHALM方法可以更可靠地鑒定傳統(tǒng)方法無法檢測(cè)到的甲基化標(biāo)記。（生物谷 Bioon.com）
資訊出處：New study points to better diagnostics for cancer
原始出處：Jianfeng Xu et al, Cellular Heterogeneity–Adjusted cLonal Methylation (CHALM) improves prediction of gene expression, Nature Communications (2021). DOI: 10.1038/s41467-020-20492-7
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