2021年2月22日 訊 /生物谷BIOON/ --近日,,一篇刊登在國際雜志Genome Research上題為“Enhancing CRISPR deletion via pharmacological delay of DNA-PKcs”的研究報告中,來自都柏林大學等機構的科學家們通過研究揭示了如何改善CRISPR的作用效率,。CRISPR 剔除(CRISPR-del,,CRISPR deletion)是一種新型的基因編輯工具,其能以外科手術般的精確性剔除或切斷活細胞中的特定DNA片段,,從而就能幫助科學家們研究機體中多種多樣但卻知之甚少的非蛋白編碼的DNA元件的功能,,這些DNA元件被科學家們稱之為基因組中的“暗物質”。
CRISPR-del技術非常實用,,其擁有著非常廣泛的應用,,比如從基礎研究到最終治療性手段的開發(fā)等;但其所面臨的主要障礙是作用效率較低,,這就限制了其應用,,也增加了實驗室工作人員的工作量,并降低了篩選應用的靈敏性,。這項研究中,,研究者Rory Johnson教授等人開始尋找能改善CRISPR剔除技術的方法,隨后他們開發(fā)出了一種新型的報道系統(tǒng)來識別能改善剔除效率的因子,。
圖片來源:Thomas Splettstoesser (Wikipedia, CC BY-SA 4.0)
文章中,,研究人員利用這種報道子進行研究發(fā)現(xiàn),,對DNA修復通路(DNA-PKcs)中的一步進行簡單便宜地藥理學抑制或能明顯增強CRISPR剔除技術的作用效率。這種方法在多個實驗室中都被證實有效,,最顯著的就是其能被用在高通量的CRISPR篩選技術中,,來識別會影響與癌癥相關的細胞存活和生長的基因和元件。
這是研究人員開發(fā)的首個方法能改善CRISPR剔除的效率,,同樣讓研究者出乎意料的是,,阻斷DNA-PKcs此前被用來抑制CRISPR的剔除而不是促進CRISPR的剔除。研究者表示,,在不完全阻斷DNA修復過程的情況下,,減緩DNA的修復過程實際上就能給予其足夠的時間來產(chǎn)生所需要的剔除元件。
CRISPR-Cas9 技術作為一種基因編輯工具,,被George Church等人于2012年首次進行描述,,從那時開始,研究人員就開始利用分子剪刀來從涉及疾病發(fā)生的基因組中剔除某些組分,,比如控制癌癥或其它遺傳性疾病的元件等,。最后研究者Johnson說道,CRISPR-Cas9的潛力在于能夠揭示新型癌癥治療靶點,,或提供基因療法來剔除患者基因組中誘發(fā)疾病的元件,,而通過提高這一過程的作用效率,科學家們距離實現(xiàn)這一潛力又更近了一步,。(生物谷Bioon.com)
原始出處:
Núria Bosch-Guiteras, Tina Uroda, Hugo A. Guillen-Ramirez, et al. Enhancing CRISPR deletion via pharmacological delay of DNA-PKcs, Genome Research (2021). DOI:10.1101/gr.265736.120
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