任何一個(gè)腫瘤都可能有成千上萬個(gè)不同的基因突變,，但對(duì)研究者而言,，#!大的挑戰(zhàn)就是如何尋找到驅(qū)動(dòng)突變，這些突變通常能夠促進(jìn)癌變效應(yīng),，有望成為潛在療法的新型靶點(diǎn)。

近日，刊登在國(guó)際雜志Nature Methods上的研究報(bào)告中,，來自麻省總醫(yī)院等機(jī)構(gòu)的研究人員成功利用一種開源計(jì)算機(jī)工具，通過將癌癥基因組數(shù)據(jù)同蛋白互作數(shù)據(jù)相結(jié)合，成功找到了驅(qū)動(dòng)癌癥的近突變,，NetSig工具就是研究者所使用的一種補(bǔ)充工具,，其能夠從當(dāng)前的分析數(shù)據(jù)流中有效擴(kuò)展對(duì)癌癥基因組的發(fā)現(xiàn)。

蛋白互作能夠揭示一類基因組臉譜,，這是一種能夠通過基因共享信息并且攜帶特殊功能的社交網(wǎng)絡(luò),，這種額外的功能視角還能幫助研究人員有效鑒別出一些高度可靠的驅(qū)動(dòng)子，尤其是很少發(fā)生突變的基因,。為了開發(fā)出NetSig工具,，研究人員對(duì)來自4742份涉及21中癌癥類型的腫瘤樣本的外顯子組數(shù)據(jù)進(jìn)行歸并整合，隨后研究人員在一系列實(shí)驗(yàn)中證實(shí)了NetSig的能力,。

這種新型工具—NetSig具有如下功能：1）能夠在所檢測(cè)的60%的腫瘤類型中識(shí)別出已知的的癌癥驅(qū)動(dòng)子,，包括那些相對(duì)較少的樣本；2）能夠預(yù)測(cè)證實(shí)實(shí)驗(yàn)證明具有促腫瘤效應(yīng)的新型驅(qū)動(dòng)基因,；3）能夠在TCGA和其它數(shù)據(jù)庫中鑒別出迄今為止未被注意的驅(qū)動(dòng)基因,，尤其是，NetSig工具還能夠發(fā)現(xiàn),，此前被認(rèn)為致癌基因陰性（也就是說,，未在患者機(jī)體中檢測(cè)到致癌基因）的肺部腫瘤患者中有4%至14%的患者或許會(huì)攜帶有促進(jìn)癌癥發(fā)生的AKT2或TFDP2基因的額外拷貝。