2020年5月7日訊 /生物谷BIOON /——一種預(yù)測(cè)最有希望的抗病毒藥物或疫苗靶點(diǎn)的新方法是基于病毒糖蛋白在識(shí)別和與宿主細(xì)胞結(jié)合過(guò)程中所經(jīng)歷的構(gòu)象變化,。這種預(yù)測(cè)方法針對(duì)自由能最高的基序的主鏈氫鍵,,相關(guān)研究成果發(fā)表在Journal of Computational Biology上,這是一本由Mary Ann Liebert出版的同行評(píng)審刊物,。
Robert Penner是法國(guó)高等教育科學(xué)研究所(Bures-sur-Yvette)和加州大學(xué)洛杉磯分校數(shù)學(xué)生物學(xué)的Rene Thom主席,,他是這篇題為"Backbone Free Energy Estimator applied to Viral Glycoproteins"的文章的作者。
圖片來(lái)源:Mary Ann Liebert, Inc., publishers
在病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞并被吸收的過(guò)程中,,病毒通常經(jīng)歷劇烈的重組,,形成融合/滲透基序。Penner提出了一種從病毒糖蛋白的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)高構(gòu)象活性殘基的通用方法,。該方法包括分析蛋白質(zhì)的氫鍵和計(jì)算相應(yīng)特征的自由能差異,,以確定構(gòu)象變化最可能發(fā)生的區(qū)域。該文提出的方法目前正用于SARS CoV-2的刺突糖蛋白,,該病毒可導(dǎo)致COVID-19,。
高等科學(xué)研究所和紐約大學(xué)的Misha Gromov表示:"一個(gè)數(shù)學(xué)思想直接導(dǎo)致一種實(shí)際意義,這簡(jiǎn)直是奇跡,,但回報(bào)是巨大的,,因?yàn)樗l(fā)生在麥克斯韋電磁場(chǎng)理論--它帶來(lái)了廣播和電視,打開(kāi)了我們的數(shù)字世界理論計(jì)算的門(mén)戶,。"他是著名數(shù)學(xué)家和阿貝爾獎(jiǎng)得主(又名諾貝爾數(shù)學(xué)獎(jiǎng)),。"只有當(dāng)它的作者除了是一位杰出的數(shù)學(xué)家外,,還具有廣闊的科學(xué)視野時(shí),這樣的想法才有可能實(shí)現(xiàn),,而這在我們這個(gè)時(shí)代最優(yōu)秀的數(shù)學(xué)家中也是罕見(jiàn)的,。Robert Penner就是這樣一位罕見(jiàn)的數(shù)學(xué)家,他發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模式的方法與世界上其他任何人都不一樣,,而蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模式是純粹數(shù)學(xué)思維的成果,。這種方法很有可能發(fā)揮作用,并加快開(kāi)發(fā)抗病毒藥物或疫苗,。但是只有實(shí)驗(yàn)才能證明這一點(diǎn),。"(生物谷Bioon.com)
參考資料:
A method for predicting antiviral drug or vaccine targets
Robert C. Penner et al. Backbone Free Energy Estimator applied to Viral Glycoproteins. Journal of Computational Biology. Apr 2020 https://doi.org/10.1089/cmb.2020.0120(潤(rùn)寶醫(yī)療網(wǎng))
Robert Penner是法國(guó)高等教育科學(xué)研究所(Bures-sur-Yvette)和加州大學(xué)洛杉磯分校數(shù)學(xué)生物學(xué)的Rene Thom主席,,他是這篇題為"Backbone Free Energy Estimator applied to Viral Glycoproteins"的文章的作者。

圖片來(lái)源:Mary Ann Liebert, Inc., publishers
在病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞并被吸收的過(guò)程中,,病毒通常經(jīng)歷劇烈的重組,,形成融合/滲透基序。Penner提出了一種從病毒糖蛋白的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)高構(gòu)象活性殘基的通用方法,。該方法包括分析蛋白質(zhì)的氫鍵和計(jì)算相應(yīng)特征的自由能差異,,以確定構(gòu)象變化最可能發(fā)生的區(qū)域。該文提出的方法目前正用于SARS CoV-2的刺突糖蛋白,,該病毒可導(dǎo)致COVID-19,。
高等科學(xué)研究所和紐約大學(xué)的Misha Gromov表示:"一個(gè)數(shù)學(xué)思想直接導(dǎo)致一種實(shí)際意義,這簡(jiǎn)直是奇跡,,但回報(bào)是巨大的,,因?yàn)樗l(fā)生在麥克斯韋電磁場(chǎng)理論--它帶來(lái)了廣播和電視,打開(kāi)了我們的數(shù)字世界理論計(jì)算的門(mén)戶,。"他是著名數(shù)學(xué)家和阿貝爾獎(jiǎng)得主(又名諾貝爾數(shù)學(xué)獎(jiǎng)),。"只有當(dāng)它的作者除了是一位杰出的數(shù)學(xué)家外,,還具有廣闊的科學(xué)視野時(shí),這樣的想法才有可能實(shí)現(xiàn),,而這在我們這個(gè)時(shí)代最優(yōu)秀的數(shù)學(xué)家中也是罕見(jiàn)的,。Robert Penner就是這樣一位罕見(jiàn)的數(shù)學(xué)家,他發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模式的方法與世界上其他任何人都不一樣,,而蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模式是純粹數(shù)學(xué)思維的成果,。這種方法很有可能發(fā)揮作用,并加快開(kāi)發(fā)抗病毒藥物或疫苗,。但是只有實(shí)驗(yàn)才能證明這一點(diǎn),。"(生物谷Bioon.com)
參考資料:
A method for predicting antiviral drug or vaccine targets
Robert C. Penner et al. Backbone Free Energy Estimator applied to Viral Glycoproteins. Journal of Computational Biology. Apr 2020 https://doi.org/10.1089/cmb.2020.0120(潤(rùn)寶醫(yī)療網(wǎng))