2020年5月14日訊 /生物谷BIOON /--目前,，COVID-19的大流行仍然持續(xù)著,，病毒對(duì)全球健康構(gòu)成持續(xù)威脅,。然而目前,，由于缺乏人體宿主如何與包括SARS-CoV-2病毒在內(nèi)的病毒相互作用的數(shù)據(jù),，限制了研究人員和醫(yī)生開發(fā)和使用有效的治療干預(yù)策略,。
近日,，以色列雷霍沃特魏茨曼科學(xué)研究所免疫學(xué)系的Ido Amit教授,、國家傳染病臨床研究中心肝病研究所和深圳市第三人民醫(yī)院的Zheng Zhang教授,、法國巴斯德研究所和CNRS的Benno Schwikowsk教授以及復(fù)旦大學(xué)上海公共衛(wèi)生臨床中心生物醫(yī)學(xué)研究所的Shuye Zhang教授合作在Cell雜志上發(fā)表文章,，通過繪制宿主-病毒感染譜揭示了嚴(yán)重COVID-19病人的特征,，文章題為"Host-viral infection maps reveal signatures of severe COVID-19 patients"。
圖片來源：Cell
該研究的亮點(diǎn)包括：
病毒追蹤：研究人員開發(fā)了一個(gè)分析宿主-病毒感染譜的計(jì)算框架,；
對(duì)感染的細(xì)胞感染進(jìn)行病毒跟蹤排序,，揭示了病毒誘導(dǎo)的基因表達(dá)；
發(fā)現(xiàn)了SARS-CoV-2感染上皮細(xì)胞并改變重癥患者的免疫功能,；
發(fā)現(xiàn)了同時(shí)感染SARS-Cov-2和hMPV會(huì)影響單核細(xì)胞和抑制干擾素反應(yīng),。
研究人員介紹了病毒追蹤（Viral-Track），這是一種計(jì)算方法,，它可以對(duì)未映射的scRNA-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行全局掃描,，以尋找病毒RNA的存在，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)受感染細(xì)胞和旁觀者細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄細(xì)胞排序,。
研究人員證明了病毒追蹤系統(tǒng)地檢測(cè)來自多種感染模型的病毒的敏感性和特異性，包括以無監(jiān)督的方式檢測(cè)乙型肝炎病毒,。
通過對(duì)COVID-19重癥和輕癥患者的支氣管灌洗液樣本進(jìn)行病毒追蹤，研究人員發(fā)現(xiàn)病毒對(duì)重癥患者免疫系統(tǒng)的影響明顯大于輕癥患者,。
此外，研究人員還在使用病毒追蹤的過程中意外地檢測(cè)到人類偏肺病毒的聯(lián)合感染,，主要存在于I型干擾素信號(hào)通路中受損的單核細(xì)胞中,。
總的來說,，研究人員開發(fā)的這種病毒追蹤技術(shù)為病毒感染和病理機(jī)制的解剖提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支持,，揭示了不同癥狀病人之間的免疫學(xué)特征，有望為不同癥狀病人的個(gè)性化給藥治療提供參考建議,。（生物谷Bioon.com）
參考資料：
PierreBost et al. Host-viral infection maps reveal signatures of severe COVID-19 patients. Cell. 2020. DOI： https：//doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.006（潤(rùn)寶醫(yī)療網(wǎng)）
近日,，以色列雷霍沃特魏茨曼科學(xué)研究所免疫學(xué)系的Ido Amit教授,、國家傳染病臨床研究中心肝病研究所和深圳市第三人民醫(yī)院的Zheng Zhang教授,、法國巴斯德研究所和CNRS的Benno Schwikowsk教授以及復(fù)旦大學(xué)上海公共衛(wèi)生臨床中心生物醫(yī)學(xué)研究所的Shuye Zhang教授合作在Cell雜志上發(fā)表文章,，通過繪制宿主-病毒感染譜揭示了嚴(yán)重COVID-19病人的特征,，文章題為"Host-viral infection maps reveal signatures of severe COVID-19 patients"。
圖片來源：Cell
該研究的亮點(diǎn)包括：
病毒追蹤：研究人員開發(fā)了一個(gè)分析宿主-病毒感染譜的計(jì)算框架,；
對(duì)感染的細(xì)胞感染進(jìn)行病毒跟蹤排序,，揭示了病毒誘導(dǎo)的基因表達(dá)；
發(fā)現(xiàn)了SARS-CoV-2感染上皮細(xì)胞并改變重癥患者的免疫功能,；
發(fā)現(xiàn)了同時(shí)感染SARS-Cov-2和hMPV會(huì)影響單核細(xì)胞和抑制干擾素反應(yīng),。
研究人員介紹了病毒追蹤（Viral-Track），這是一種計(jì)算方法,，它可以對(duì)未映射的scRNA-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行全局掃描,，以尋找病毒RNA的存在，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)受感染細(xì)胞和旁觀者細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄細(xì)胞排序,。
研究人員證明了病毒追蹤系統(tǒng)地檢測(cè)來自多種感染模型的病毒的敏感性和特異性，包括以無監(jiān)督的方式檢測(cè)乙型肝炎病毒,。
通過對(duì)COVID-19重癥和輕癥患者的支氣管灌洗液樣本進(jìn)行病毒追蹤，研究人員發(fā)現(xiàn)病毒對(duì)重癥患者免疫系統(tǒng)的影響明顯大于輕癥患者,。
此外，研究人員還在使用病毒追蹤的過程中意外地檢測(cè)到人類偏肺病毒的聯(lián)合感染,，主要存在于I型干擾素信號(hào)通路中受損的單核細(xì)胞中,。
總的來說,，研究人員開發(fā)的這種病毒追蹤技術(shù)為病毒感染和病理機(jī)制的解剖提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支持,，揭示了不同癥狀病人之間的免疫學(xué)特征，有望為不同癥狀病人的個(gè)性化給藥治療提供參考建議,。（生物谷Bioon.com）
參考資料：
PierreBost et al. Host-viral infection maps reveal signatures of severe COVID-19 patients. Cell. 2020. DOI： https：//doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.006（潤(rùn)寶醫(yī)療網(wǎng)）
